Protein–RNA interactions for Protein: Q91WL6

Snx11, Sorting nexin-11, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx11Q91WL6 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Snx11Q91WL6 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snx11Q91WL6 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snx11Q91WL6 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Snx11Q91WL6 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx11Q91WL6 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx11Q91WL6 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx11Q91WL6 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx11Q91WL6 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx11Q91WL6 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx11Q91WL6 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx11Q91WL6 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx11Q91WL6 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx11Q91WL6 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx11Q91WL6 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx11Q91WL6 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx11Q91WL6 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx11Q91WL6 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx11Q91WL6 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx11Q91WL6 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx11Q91WL6 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx11Q91WL6 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx11Q91WL6 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx11Q91WL6 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx11Q91WL6 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx11Q91WL6 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx11Q91WL6 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx11Q91WL6 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx11Q91WL6 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx11Q91WL6 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx11Q91WL6 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx11Q91WL6 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx11Q91WL6 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx11Q91WL6 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx11Q91WL6 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx11Q91WL6 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx11Q91WL6 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx11Q91WL6 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx11Q91WL6 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx11Q91WL6 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx11Q91WL6 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx11Q91WL6 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx11Q91WL6 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx11Q91WL6 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx11Q91WL6 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx11Q91WL6 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snx11Q91WL6 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snx11Q91WL6 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snx11Q91WL6 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snx11Q91WL6 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snx11Q91WL6 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snx11Q91WL6 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snx11Q91WL6 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snx11Q91WL6 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snx11Q91WL6 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snx11Q91WL6 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx11Q91WL6 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx11Q91WL6 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx11Q91WL6 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx11Q91WL6 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx11Q91WL6 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx11Q91WL6 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx11Q91WL6 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx11Q91WL6 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx11Q91WL6 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx11Q91WL6 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx11Q91WL6 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx11Q91WL6 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx11Q91WL6 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx11Q91WL6 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx11Q91WL6 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx11Q91WL6 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx11Q91WL6 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx11Q91WL6 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx11Q91WL6 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx11Q91WL6 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx11Q91WL6 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx11Q91WL6 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx11Q91WL6 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx11Q91WL6 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx11Q91WL6 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx11Q91WL6 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx11Q91WL6 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx11Q91WL6 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx11Q91WL6 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx11Q91WL6 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx11Q91WL6 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx11Q91WL6 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx11Q91WL6 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx11Q91WL6 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx11Q91WL6 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx11Q91WL6 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx11Q91WL6 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx11Q91WL6 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx11Q91WL6 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx11Q91WL6 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx11Q91WL6 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx11Q91WL6 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx11Q91WL6 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx11Q91WL6 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms