Protein–RNA interactions for Protein: Q91VE6

Nifk, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NifkQ91VE6 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NifkQ91VE6 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NifkQ91VE6 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NifkQ91VE6 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NifkQ91VE6 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NifkQ91VE6 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NifkQ91VE6 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
NifkQ91VE6 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NifkQ91VE6 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NifkQ91VE6 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NifkQ91VE6 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NifkQ91VE6 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NifkQ91VE6 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NifkQ91VE6 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NifkQ91VE6 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NifkQ91VE6 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NifkQ91VE6 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NifkQ91VE6 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NifkQ91VE6 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NifkQ91VE6 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NifkQ91VE6 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NifkQ91VE6 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NifkQ91VE6 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NifkQ91VE6 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NifkQ91VE6 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NifkQ91VE6 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NifkQ91VE6 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NifkQ91VE6 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NifkQ91VE6 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NifkQ91VE6 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NifkQ91VE6 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NifkQ91VE6 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NifkQ91VE6 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NifkQ91VE6 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NifkQ91VE6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NifkQ91VE6 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NifkQ91VE6 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NifkQ91VE6 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NifkQ91VE6 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NifkQ91VE6 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NifkQ91VE6 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NifkQ91VE6 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NifkQ91VE6 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
NifkQ91VE6 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
NifkQ91VE6 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NifkQ91VE6 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NifkQ91VE6 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NifkQ91VE6 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NifkQ91VE6 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NifkQ91VE6 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NifkQ91VE6 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NifkQ91VE6 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NifkQ91VE6 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NifkQ91VE6 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NifkQ91VE6 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NifkQ91VE6 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NifkQ91VE6 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NifkQ91VE6 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NifkQ91VE6 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NifkQ91VE6 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NifkQ91VE6 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NifkQ91VE6 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NifkQ91VE6 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NifkQ91VE6 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NifkQ91VE6 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NifkQ91VE6 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NifkQ91VE6 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NifkQ91VE6 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NifkQ91VE6 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NifkQ91VE6 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NifkQ91VE6 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NifkQ91VE6 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NifkQ91VE6 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NifkQ91VE6 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NifkQ91VE6 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
NifkQ91VE6 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NifkQ91VE6 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NifkQ91VE6 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NifkQ91VE6 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NifkQ91VE6 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NifkQ91VE6 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NifkQ91VE6 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NifkQ91VE6 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NifkQ91VE6 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NifkQ91VE6 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NifkQ91VE6 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NifkQ91VE6 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NifkQ91VE6 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NifkQ91VE6 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NifkQ91VE6 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NifkQ91VE6 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NifkQ91VE6 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NifkQ91VE6 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NifkQ91VE6 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NifkQ91VE6 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NifkQ91VE6 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NifkQ91VE6 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NifkQ91VE6 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NifkQ91VE6 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NifkQ91VE6 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms