Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHS2

Crb1, Protein crumbs homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crb1Q8VHS2 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Crb1Q8VHS2 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Crb1Q8VHS2 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Crb1Q8VHS2 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Crb1Q8VHS2 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Crb1Q8VHS2 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Crb1Q8VHS2 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Crb1Q8VHS2 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Crb1Q8VHS2 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Crb1Q8VHS2 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Crb1Q8VHS2 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Crb1Q8VHS2 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Crb1Q8VHS2 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Crb1Q8VHS2 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Crb1Q8VHS2 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Crb1Q8VHS2 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Crb1Q8VHS2 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Crb1Q8VHS2 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Crb1Q8VHS2 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Crb1Q8VHS2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Crb1Q8VHS2 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Crb1Q8VHS2 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Crb1Q8VHS2 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Crb1Q8VHS2 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Crb1Q8VHS2 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Crb1Q8VHS2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Crb1Q8VHS2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Crb1Q8VHS2 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Crb1Q8VHS2 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Crb1Q8VHS2 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Crb1Q8VHS2 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Crb1Q8VHS2 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Crb1Q8VHS2 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Crb1Q8VHS2 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Crb1Q8VHS2 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Crb1Q8VHS2 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Crb1Q8VHS2 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Crb1Q8VHS2 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Crb1Q8VHS2 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Crb1Q8VHS2 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Crb1Q8VHS2 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Crb1Q8VHS2 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Crb1Q8VHS2 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Crb1Q8VHS2 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Crb1Q8VHS2 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Crb1Q8VHS2 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Crb1Q8VHS2 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Crb1Q8VHS2 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Crb1Q8VHS2 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Crb1Q8VHS2 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Crb1Q8VHS2 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Crb1Q8VHS2 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Crb1Q8VHS2 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Crb1Q8VHS2 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Crb1Q8VHS2 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Crb1Q8VHS2 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Crb1Q8VHS2 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Crb1Q8VHS2 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Crb1Q8VHS2 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Crb1Q8VHS2 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Crb1Q8VHS2 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Crb1Q8VHS2 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Crb1Q8VHS2 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Crb1Q8VHS2 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Crb1Q8VHS2 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Crb1Q8VHS2 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Crb1Q8VHS2 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Crb1Q8VHS2 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Crb1Q8VHS2 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Crb1Q8VHS2 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Crb1Q8VHS2 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Crb1Q8VHS2 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Crb1Q8VHS2 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Crb1Q8VHS2 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Crb1Q8VHS2 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Crb1Q8VHS2 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Crb1Q8VHS2 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Crb1Q8VHS2 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Crb1Q8VHS2 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Crb1Q8VHS2 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Crb1Q8VHS2 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Crb1Q8VHS2 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Crb1Q8VHS2 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Crb1Q8VHS2 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Crb1Q8VHS2 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Crb1Q8VHS2 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Crb1Q8VHS2 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Crb1Q8VHS2 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Crb1Q8VHS2 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Crb1Q8VHS2 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Crb1Q8VHS2 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Crb1Q8VHS2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Crb1Q8VHS2 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Crb1Q8VHS2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Crb1Q8VHS2 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Crb1Q8VHS2 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Crb1Q8VHS2 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Crb1Q8VHS2 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Crb1Q8VHS2 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Crb1Q8VHS2 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms