Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEG6

Cnot6l, CCR4-NOT transcription complex subunit 6-like, mousemouse

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot6lQ8VEG6 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cnot6lQ8VEG6 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cnot6lQ8VEG6 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cnot6lQ8VEG6 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cnot6lQ8VEG6 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Cnot6lQ8VEG6 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Cnot6lQ8VEG6 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cnot6lQ8VEG6 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cnot6lQ8VEG6 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cnot6lQ8VEG6 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cnot6lQ8VEG6 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cnot6lQ8VEG6 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cnot6lQ8VEG6 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cnot6lQ8VEG6 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cnot6lQ8VEG6 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cnot6lQ8VEG6 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cnot6lQ8VEG6 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cnot6lQ8VEG6 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cnot6lQ8VEG6 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cnot6lQ8VEG6 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cnot6lQ8VEG6 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Cnot6lQ8VEG6 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cnot6lQ8VEG6 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cnot6lQ8VEG6 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cnot6lQ8VEG6 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cnot6lQ8VEG6 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cnot6lQ8VEG6 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cnot6lQ8VEG6 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cnot6lQ8VEG6 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cnot6lQ8VEG6 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cnot6lQ8VEG6 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cnot6lQ8VEG6 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cnot6lQ8VEG6 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cnot6lQ8VEG6 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cnot6lQ8VEG6 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cnot6lQ8VEG6 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cnot6lQ8VEG6 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cnot6lQ8VEG6 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cnot6lQ8VEG6 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Cnot6lQ8VEG6 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cnot6lQ8VEG6 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cnot6lQ8VEG6 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Cnot6lQ8VEG6 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cnot6lQ8VEG6 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cnot6lQ8VEG6 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cnot6lQ8VEG6 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Cnot6lQ8VEG6 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cnot6lQ8VEG6 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cnot6lQ8VEG6 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cnot6lQ8VEG6 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cnot6lQ8VEG6 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cnot6lQ8VEG6 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cnot6lQ8VEG6 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cnot6lQ8VEG6 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cnot6lQ8VEG6 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cnot6lQ8VEG6 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cnot6lQ8VEG6 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cnot6lQ8VEG6 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cnot6lQ8VEG6 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cnot6lQ8VEG6 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cnot6lQ8VEG6 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cnot6lQ8VEG6 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cnot6lQ8VEG6 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Cnot6lQ8VEG6 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cnot6lQ8VEG6 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cnot6lQ8VEG6 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cnot6lQ8VEG6 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cnot6lQ8VEG6 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cnot6lQ8VEG6 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cnot6lQ8VEG6 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cnot6lQ8VEG6 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cnot6lQ8VEG6 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cnot6lQ8VEG6 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cnot6lQ8VEG6 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cnot6lQ8VEG6 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cnot6lQ8VEG6 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cnot6lQ8VEG6 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Cnot6lQ8VEG6 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cnot6lQ8VEG6 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cnot6lQ8VEG6 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cnot6lQ8VEG6 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cnot6lQ8VEG6 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cnot6lQ8VEG6 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cnot6lQ8VEG6 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cnot6lQ8VEG6 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cnot6lQ8VEG6 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Cnot6lQ8VEG6 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cnot6lQ8VEG6 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Cnot6lQ8VEG6 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cnot6lQ8VEG6 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cnot6lQ8VEG6 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cnot6lQ8VEG6 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cnot6lQ8VEG6 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cnot6lQ8VEG6 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cnot6lQ8VEG6 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cnot6lQ8VEG6 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cnot6lQ8VEG6 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cnot6lQ8VEG6 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cnot6lQ8VEG6 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cnot6lQ8VEG6 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms