Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE99

Ccdc115, Coiled-coil domain-containing protein 115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc115Q8VE99 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc115Q8VE99 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc115Q8VE99 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc115Q8VE99 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc115Q8VE99 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc115Q8VE99 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc115Q8VE99 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc115Q8VE99 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc115Q8VE99 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc115Q8VE99 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc115Q8VE99 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc115Q8VE99 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ccdc115Q8VE99 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ccdc115Q8VE99 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc115Q8VE99 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc115Q8VE99 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc115Q8VE99 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc115Q8VE99 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc115Q8VE99 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc115Q8VE99 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc115Q8VE99 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc115Q8VE99 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc115Q8VE99 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc115Q8VE99 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc115Q8VE99 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc115Q8VE99 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc115Q8VE99 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc115Q8VE99 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc115Q8VE99 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc115Q8VE99 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc115Q8VE99 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc115Q8VE99 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc115Q8VE99 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc115Q8VE99 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc115Q8VE99 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc115Q8VE99 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc115Q8VE99 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc115Q8VE99 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc115Q8VE99 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc115Q8VE99 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc115Q8VE99 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc115Q8VE99 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc115Q8VE99 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc115Q8VE99 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc115Q8VE99 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc115Q8VE99 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc115Q8VE99 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc115Q8VE99 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc115Q8VE99 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc115Q8VE99 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc115Q8VE99 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc115Q8VE99 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc115Q8VE99 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc115Q8VE99 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc115Q8VE99 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc115Q8VE99 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc115Q8VE99 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc115Q8VE99 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc115Q8VE99 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc115Q8VE99 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc115Q8VE99 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc115Q8VE99 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc115Q8VE99 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc115Q8VE99 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc115Q8VE99 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc115Q8VE99 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc115Q8VE99 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc115Q8VE99 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc115Q8VE99 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc115Q8VE99 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc115Q8VE99 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc115Q8VE99 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc115Q8VE99 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc115Q8VE99 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc115Q8VE99 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc115Q8VE99 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc115Q8VE99 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc115Q8VE99 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc115Q8VE99 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc115Q8VE99 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc115Q8VE99 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc115Q8VE99 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc115Q8VE99 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc115Q8VE99 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc115Q8VE99 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc115Q8VE99 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc115Q8VE99 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc115Q8VE99 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc115Q8VE99 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc115Q8VE99 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc115Q8VE99 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc115Q8VE99 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc115Q8VE99 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc115Q8VE99 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc115Q8VE99 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc115Q8VE99 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc115Q8VE99 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc115Q8VE99 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc115Q8VE99 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc115Q8VE99 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms