Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE47

Uba5, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 5, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uba5Q8VE47 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Uba5Q8VE47 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Uba5Q8VE47 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Uba5Q8VE47 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Uba5Q8VE47 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Uba5Q8VE47 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Uba5Q8VE47 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Uba5Q8VE47 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Uba5Q8VE47 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Uba5Q8VE47 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Uba5Q8VE47 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Uba5Q8VE47 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Uba5Q8VE47 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Uba5Q8VE47 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Uba5Q8VE47 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Uba5Q8VE47 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Uba5Q8VE47 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Uba5Q8VE47 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Uba5Q8VE47 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Uba5Q8VE47 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Uba5Q8VE47 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Uba5Q8VE47 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Uba5Q8VE47 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Uba5Q8VE47 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Uba5Q8VE47 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Uba5Q8VE47 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Uba5Q8VE47 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Uba5Q8VE47 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Uba5Q8VE47 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Uba5Q8VE47 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Uba5Q8VE47 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Uba5Q8VE47 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Uba5Q8VE47 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Uba5Q8VE47 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Uba5Q8VE47 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Uba5Q8VE47 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Uba5Q8VE47 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Uba5Q8VE47 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Uba5Q8VE47 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Uba5Q8VE47 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Uba5Q8VE47 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Uba5Q8VE47 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Uba5Q8VE47 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Uba5Q8VE47 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Uba5Q8VE47 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Uba5Q8VE47 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Uba5Q8VE47 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Uba5Q8VE47 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Uba5Q8VE47 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Uba5Q8VE47 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Uba5Q8VE47 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Uba5Q8VE47 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Uba5Q8VE47 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Uba5Q8VE47 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Uba5Q8VE47 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Uba5Q8VE47 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Uba5Q8VE47 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Uba5Q8VE47 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Uba5Q8VE47 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Uba5Q8VE47 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Uba5Q8VE47 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Uba5Q8VE47 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Uba5Q8VE47 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Uba5Q8VE47 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Uba5Q8VE47 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Uba5Q8VE47 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Uba5Q8VE47 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Uba5Q8VE47 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Uba5Q8VE47 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Uba5Q8VE47 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Uba5Q8VE47 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Uba5Q8VE47 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Uba5Q8VE47 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Uba5Q8VE47 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Uba5Q8VE47 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Uba5Q8VE47 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Uba5Q8VE47 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Uba5Q8VE47 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Uba5Q8VE47 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Uba5Q8VE47 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Uba5Q8VE47 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Uba5Q8VE47 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Uba5Q8VE47 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Uba5Q8VE47 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Uba5Q8VE47 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Uba5Q8VE47 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Uba5Q8VE47 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Uba5Q8VE47 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Uba5Q8VE47 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Uba5Q8VE47 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Uba5Q8VE47 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Uba5Q8VE47 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Uba5Q8VE47 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Uba5Q8VE47 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Uba5Q8VE47 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Uba5Q8VE47 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Uba5Q8VE47 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Uba5Q8VE47 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Uba5Q8VE47 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Uba5Q8VE47 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms