Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDJ3

Hdlbp, Vigilin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HdlbpQ8VDJ3 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HdlbpQ8VDJ3 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HdlbpQ8VDJ3 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HdlbpQ8VDJ3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HdlbpQ8VDJ3 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HdlbpQ8VDJ3 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HdlbpQ8VDJ3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HdlbpQ8VDJ3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HdlbpQ8VDJ3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HdlbpQ8VDJ3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HdlbpQ8VDJ3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HdlbpQ8VDJ3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HdlbpQ8VDJ3 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
HdlbpQ8VDJ3 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HdlbpQ8VDJ3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HdlbpQ8VDJ3 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HdlbpQ8VDJ3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HdlbpQ8VDJ3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HdlbpQ8VDJ3 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
HdlbpQ8VDJ3 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HdlbpQ8VDJ3 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HdlbpQ8VDJ3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HdlbpQ8VDJ3 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HdlbpQ8VDJ3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HdlbpQ8VDJ3 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HdlbpQ8VDJ3 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HdlbpQ8VDJ3 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HdlbpQ8VDJ3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HdlbpQ8VDJ3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HdlbpQ8VDJ3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HdlbpQ8VDJ3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HdlbpQ8VDJ3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HdlbpQ8VDJ3 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HdlbpQ8VDJ3 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
HdlbpQ8VDJ3 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HdlbpQ8VDJ3 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
HdlbpQ8VDJ3 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
HdlbpQ8VDJ3 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HdlbpQ8VDJ3 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HdlbpQ8VDJ3 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HdlbpQ8VDJ3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HdlbpQ8VDJ3 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HdlbpQ8VDJ3 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HdlbpQ8VDJ3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HdlbpQ8VDJ3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HdlbpQ8VDJ3 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HdlbpQ8VDJ3 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HdlbpQ8VDJ3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HdlbpQ8VDJ3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HdlbpQ8VDJ3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HdlbpQ8VDJ3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
HdlbpQ8VDJ3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HdlbpQ8VDJ3 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HdlbpQ8VDJ3 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HdlbpQ8VDJ3 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HdlbpQ8VDJ3 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HdlbpQ8VDJ3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HdlbpQ8VDJ3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HdlbpQ8VDJ3 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HdlbpQ8VDJ3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HdlbpQ8VDJ3 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HdlbpQ8VDJ3 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HdlbpQ8VDJ3 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HdlbpQ8VDJ3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HdlbpQ8VDJ3 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HdlbpQ8VDJ3 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HdlbpQ8VDJ3 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HdlbpQ8VDJ3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HdlbpQ8VDJ3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HdlbpQ8VDJ3 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HdlbpQ8VDJ3 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HdlbpQ8VDJ3 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HdlbpQ8VDJ3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HdlbpQ8VDJ3 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HdlbpQ8VDJ3 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HdlbpQ8VDJ3 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HdlbpQ8VDJ3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HdlbpQ8VDJ3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HdlbpQ8VDJ3 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HdlbpQ8VDJ3 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HdlbpQ8VDJ3 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HdlbpQ8VDJ3 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HdlbpQ8VDJ3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HdlbpQ8VDJ3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HdlbpQ8VDJ3 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HdlbpQ8VDJ3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HdlbpQ8VDJ3 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HdlbpQ8VDJ3 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HdlbpQ8VDJ3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HdlbpQ8VDJ3 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HdlbpQ8VDJ3 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HdlbpQ8VDJ3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HdlbpQ8VDJ3 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HdlbpQ8VDJ3 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HdlbpQ8VDJ3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HdlbpQ8VDJ3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HdlbpQ8VDJ3 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HdlbpQ8VDJ3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HdlbpQ8VDJ3 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HdlbpQ8VDJ3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms