Protein–RNA interactions for Protein: Q8R361

Rab11fip5, Rab11 family-interacting protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 645 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip5Q8R361 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab11fip5Q8R361 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab11fip5Q8R361 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab11fip5Q8R361 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab11fip5Q8R361 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab11fip5Q8R361 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab11fip5Q8R361 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab11fip5Q8R361 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab11fip5Q8R361 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab11fip5Q8R361 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab11fip5Q8R361 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab11fip5Q8R361 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab11fip5Q8R361 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab11fip5Q8R361 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab11fip5Q8R361 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab11fip5Q8R361 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab11fip5Q8R361 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab11fip5Q8R361 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab11fip5Q8R361 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab11fip5Q8R361 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab11fip5Q8R361 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab11fip5Q8R361 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab11fip5Q8R361 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab11fip5Q8R361 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab11fip5Q8R361 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab11fip5Q8R361 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab11fip5Q8R361 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab11fip5Q8R361 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab11fip5Q8R361 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab11fip5Q8R361 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab11fip5Q8R361 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab11fip5Q8R361 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab11fip5Q8R361 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab11fip5Q8R361 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab11fip5Q8R361 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab11fip5Q8R361 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab11fip5Q8R361 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab11fip5Q8R361 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab11fip5Q8R361 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab11fip5Q8R361 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab11fip5Q8R361 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab11fip5Q8R361 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab11fip5Q8R361 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab11fip5Q8R361 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab11fip5Q8R361 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab11fip5Q8R361 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab11fip5Q8R361 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab11fip5Q8R361 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab11fip5Q8R361 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab11fip5Q8R361 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab11fip5Q8R361 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab11fip5Q8R361 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab11fip5Q8R361 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab11fip5Q8R361 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab11fip5Q8R361 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab11fip5Q8R361 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab11fip5Q8R361 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab11fip5Q8R361 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab11fip5Q8R361 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab11fip5Q8R361 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab11fip5Q8R361 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab11fip5Q8R361 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab11fip5Q8R361 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab11fip5Q8R361 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab11fip5Q8R361 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab11fip5Q8R361 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab11fip5Q8R361 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab11fip5Q8R361 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab11fip5Q8R361 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab11fip5Q8R361 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab11fip5Q8R361 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab11fip5Q8R361 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab11fip5Q8R361 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab11fip5Q8R361 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab11fip5Q8R361 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab11fip5Q8R361 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab11fip5Q8R361 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab11fip5Q8R361 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab11fip5Q8R361 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab11fip5Q8R361 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab11fip5Q8R361 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab11fip5Q8R361 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab11fip5Q8R361 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab11fip5Q8R361 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab11fip5Q8R361 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab11fip5Q8R361 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab11fip5Q8R361 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab11fip5Q8R361 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab11fip5Q8R361 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab11fip5Q8R361 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab11fip5Q8R361 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab11fip5Q8R361 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab11fip5Q8R361 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab11fip5Q8R361 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab11fip5Q8R361 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab11fip5Q8R361 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab11fip5Q8R361 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab11fip5Q8R361 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab11fip5Q8R361 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab11fip5Q8R361 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms