Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1P4

Atg10, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG10, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg10Q8R1P4 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atg10Q8R1P4 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atg10Q8R1P4 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atg10Q8R1P4 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atg10Q8R1P4 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atg10Q8R1P4 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atg10Q8R1P4 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atg10Q8R1P4 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atg10Q8R1P4 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atg10Q8R1P4 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atg10Q8R1P4 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atg10Q8R1P4 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atg10Q8R1P4 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atg10Q8R1P4 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atg10Q8R1P4 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atg10Q8R1P4 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atg10Q8R1P4 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atg10Q8R1P4 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atg10Q8R1P4 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atg10Q8R1P4 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atg10Q8R1P4 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Atg10Q8R1P4 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atg10Q8R1P4 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atg10Q8R1P4 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atg10Q8R1P4 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atg10Q8R1P4 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atg10Q8R1P4 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atg10Q8R1P4 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atg10Q8R1P4 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atg10Q8R1P4 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atg10Q8R1P4 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atg10Q8R1P4 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atg10Q8R1P4 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Atg10Q8R1P4 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atg10Q8R1P4 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atg10Q8R1P4 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atg10Q8R1P4 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atg10Q8R1P4 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atg10Q8R1P4 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atg10Q8R1P4 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atg10Q8R1P4 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atg10Q8R1P4 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atg10Q8R1P4 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Atg10Q8R1P4 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atg10Q8R1P4 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Atg10Q8R1P4 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atg10Q8R1P4 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atg10Q8R1P4 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atg10Q8R1P4 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atg10Q8R1P4 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atg10Q8R1P4 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atg10Q8R1P4 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atg10Q8R1P4 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atg10Q8R1P4 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atg10Q8R1P4 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atg10Q8R1P4 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atg10Q8R1P4 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atg10Q8R1P4 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Atg10Q8R1P4 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Atg10Q8R1P4 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Atg10Q8R1P4 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Atg10Q8R1P4 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atg10Q8R1P4 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atg10Q8R1P4 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Atg10Q8R1P4 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atg10Q8R1P4 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atg10Q8R1P4 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atg10Q8R1P4 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atg10Q8R1P4 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atg10Q8R1P4 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atg10Q8R1P4 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atg10Q8R1P4 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atg10Q8R1P4 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Atg10Q8R1P4 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atg10Q8R1P4 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atg10Q8R1P4 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atg10Q8R1P4 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atg10Q8R1P4 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atg10Q8R1P4 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atg10Q8R1P4 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atg10Q8R1P4 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atg10Q8R1P4 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atg10Q8R1P4 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atg10Q8R1P4 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atg10Q8R1P4 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atg10Q8R1P4 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atg10Q8R1P4 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atg10Q8R1P4 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atg10Q8R1P4 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atg10Q8R1P4 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atg10Q8R1P4 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg10Q8R1P4 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg10Q8R1P4 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg10Q8R1P4 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg10Q8R1P4 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg10Q8R1P4 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg10Q8R1P4 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg10Q8R1P4 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg10Q8R1P4 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg10Q8R1P4 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms