Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0W1

Cipc, CLOCK-interacting pacemaker, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CipcQ8R0W1 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CipcQ8R0W1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CipcQ8R0W1 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CipcQ8R0W1 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CipcQ8R0W1 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CipcQ8R0W1 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CipcQ8R0W1 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CipcQ8R0W1 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CipcQ8R0W1 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CipcQ8R0W1 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CipcQ8R0W1 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CipcQ8R0W1 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CipcQ8R0W1 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CipcQ8R0W1 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CipcQ8R0W1 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CipcQ8R0W1 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CipcQ8R0W1 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CipcQ8R0W1 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CipcQ8R0W1 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CipcQ8R0W1 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CipcQ8R0W1 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CipcQ8R0W1 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CipcQ8R0W1 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CipcQ8R0W1 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CipcQ8R0W1 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CipcQ8R0W1 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CipcQ8R0W1 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CipcQ8R0W1 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CipcQ8R0W1 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CipcQ8R0W1 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CipcQ8R0W1 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CipcQ8R0W1 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CipcQ8R0W1 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CipcQ8R0W1 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CipcQ8R0W1 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CipcQ8R0W1 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CipcQ8R0W1 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CipcQ8R0W1 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CipcQ8R0W1 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CipcQ8R0W1 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CipcQ8R0W1 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CipcQ8R0W1 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CipcQ8R0W1 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CipcQ8R0W1 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CipcQ8R0W1 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CipcQ8R0W1 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CipcQ8R0W1 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CipcQ8R0W1 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CipcQ8R0W1 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CipcQ8R0W1 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CipcQ8R0W1 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CipcQ8R0W1 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CipcQ8R0W1 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CipcQ8R0W1 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CipcQ8R0W1 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CipcQ8R0W1 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CipcQ8R0W1 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CipcQ8R0W1 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CipcQ8R0W1 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CipcQ8R0W1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CipcQ8R0W1 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CipcQ8R0W1 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CipcQ8R0W1 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CipcQ8R0W1 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CipcQ8R0W1 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CipcQ8R0W1 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CipcQ8R0W1 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CipcQ8R0W1 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CipcQ8R0W1 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CipcQ8R0W1 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CipcQ8R0W1 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CipcQ8R0W1 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CipcQ8R0W1 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CipcQ8R0W1 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CipcQ8R0W1 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CipcQ8R0W1 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CipcQ8R0W1 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CipcQ8R0W1 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CipcQ8R0W1 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CipcQ8R0W1 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CipcQ8R0W1 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CipcQ8R0W1 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CipcQ8R0W1 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CipcQ8R0W1 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CipcQ8R0W1 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CipcQ8R0W1 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CipcQ8R0W1 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CipcQ8R0W1 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CipcQ8R0W1 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CipcQ8R0W1 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CipcQ8R0W1 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CipcQ8R0W1 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CipcQ8R0W1 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CipcQ8R0W1 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CipcQ8R0W1 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CipcQ8R0W1 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CipcQ8R0W1 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CipcQ8R0W1 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CipcQ8R0W1 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CipcQ8R0W1 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms