Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0K9

E2f4, Transcription factor E2F4, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f4Q8R0K9 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
E2f4Q8R0K9 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
E2f4Q8R0K9 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
E2f4Q8R0K9 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
E2f4Q8R0K9 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
E2f4Q8R0K9 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
E2f4Q8R0K9 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
E2f4Q8R0K9 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
E2f4Q8R0K9 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
E2f4Q8R0K9 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
E2f4Q8R0K9 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
E2f4Q8R0K9 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
E2f4Q8R0K9 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
E2f4Q8R0K9 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
E2f4Q8R0K9 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
E2f4Q8R0K9 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.27■■□□□ 1
E2f4Q8R0K9 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
E2f4Q8R0K9 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
E2f4Q8R0K9 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
E2f4Q8R0K9 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
E2f4Q8R0K9 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
E2f4Q8R0K9 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
E2f4Q8R0K9 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
E2f4Q8R0K9 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
E2f4Q8R0K9 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
E2f4Q8R0K9 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
E2f4Q8R0K9 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
E2f4Q8R0K9 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
E2f4Q8R0K9 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
E2f4Q8R0K9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
E2f4Q8R0K9 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
E2f4Q8R0K9 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
E2f4Q8R0K9 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
E2f4Q8R0K9 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
E2f4Q8R0K9 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
E2f4Q8R0K9 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
E2f4Q8R0K9 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
E2f4Q8R0K9 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
E2f4Q8R0K9 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
E2f4Q8R0K9 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
E2f4Q8R0K9 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
E2f4Q8R0K9 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
E2f4Q8R0K9 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
E2f4Q8R0K9 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
E2f4Q8R0K9 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
E2f4Q8R0K9 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
E2f4Q8R0K9 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
E2f4Q8R0K9 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
E2f4Q8R0K9 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
E2f4Q8R0K9 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
E2f4Q8R0K9 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
E2f4Q8R0K9 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
E2f4Q8R0K9 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
E2f4Q8R0K9 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
E2f4Q8R0K9 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
E2f4Q8R0K9 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
E2f4Q8R0K9 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
E2f4Q8R0K9 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
E2f4Q8R0K9 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
E2f4Q8R0K9 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
E2f4Q8R0K9 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
E2f4Q8R0K9 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
E2f4Q8R0K9 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
E2f4Q8R0K9 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
E2f4Q8R0K9 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
E2f4Q8R0K9 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
E2f4Q8R0K9 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
E2f4Q8R0K9 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
E2f4Q8R0K9 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
E2f4Q8R0K9 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
E2f4Q8R0K9 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
E2f4Q8R0K9 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
E2f4Q8R0K9 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
E2f4Q8R0K9 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
E2f4Q8R0K9 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
E2f4Q8R0K9 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
E2f4Q8R0K9 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
E2f4Q8R0K9 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
E2f4Q8R0K9 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
E2f4Q8R0K9 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
E2f4Q8R0K9 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
E2f4Q8R0K9 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
E2f4Q8R0K9 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
E2f4Q8R0K9 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
E2f4Q8R0K9 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
E2f4Q8R0K9 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
E2f4Q8R0K9 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
E2f4Q8R0K9 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
E2f4Q8R0K9 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
E2f4Q8R0K9 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
E2f4Q8R0K9 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
E2f4Q8R0K9 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
E2f4Q8R0K9 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
E2f4Q8R0K9 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
E2f4Q8R0K9 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
E2f4Q8R0K9 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
E2f4Q8R0K9 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
E2f4Q8R0K9 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
E2f4Q8R0K9 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
E2f4Q8R0K9 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms