Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0F3

Sumf1, Sulfatase-modifying factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sumf1Q8R0F3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sumf1Q8R0F3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sumf1Q8R0F3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sumf1Q8R0F3 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sumf1Q8R0F3 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Sumf1Q8R0F3 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sumf1Q8R0F3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sumf1Q8R0F3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sumf1Q8R0F3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sumf1Q8R0F3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Sumf1Q8R0F3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Sumf1Q8R0F3 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Sumf1Q8R0F3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sumf1Q8R0F3 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sumf1Q8R0F3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sumf1Q8R0F3 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sumf1Q8R0F3 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sumf1Q8R0F3 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Sumf1Q8R0F3 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Sumf1Q8R0F3 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sumf1Q8R0F3 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sumf1Q8R0F3 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sumf1Q8R0F3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sumf1Q8R0F3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sumf1Q8R0F3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sumf1Q8R0F3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sumf1Q8R0F3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sumf1Q8R0F3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sumf1Q8R0F3 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sumf1Q8R0F3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sumf1Q8R0F3 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sumf1Q8R0F3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sumf1Q8R0F3 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sumf1Q8R0F3 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sumf1Q8R0F3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sumf1Q8R0F3 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sumf1Q8R0F3 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sumf1Q8R0F3 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sumf1Q8R0F3 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sumf1Q8R0F3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sumf1Q8R0F3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Sumf1Q8R0F3 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sumf1Q8R0F3 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sumf1Q8R0F3 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sumf1Q8R0F3 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sumf1Q8R0F3 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sumf1Q8R0F3 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sumf1Q8R0F3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sumf1Q8R0F3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sumf1Q8R0F3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sumf1Q8R0F3 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sumf1Q8R0F3 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sumf1Q8R0F3 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sumf1Q8R0F3 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sumf1Q8R0F3 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sumf1Q8R0F3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sumf1Q8R0F3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sumf1Q8R0F3 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sumf1Q8R0F3 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sumf1Q8R0F3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sumf1Q8R0F3 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Sumf1Q8R0F3 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sumf1Q8R0F3 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sumf1Q8R0F3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sumf1Q8R0F3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sumf1Q8R0F3 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sumf1Q8R0F3 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sumf1Q8R0F3 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sumf1Q8R0F3 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sumf1Q8R0F3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sumf1Q8R0F3 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sumf1Q8R0F3 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sumf1Q8R0F3 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Sumf1Q8R0F3 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sumf1Q8R0F3 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sumf1Q8R0F3 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Sumf1Q8R0F3 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sumf1Q8R0F3 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sumf1Q8R0F3 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sumf1Q8R0F3 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sumf1Q8R0F3 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sumf1Q8R0F3 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sumf1Q8R0F3 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sumf1Q8R0F3 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sumf1Q8R0F3 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sumf1Q8R0F3 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sumf1Q8R0F3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sumf1Q8R0F3 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sumf1Q8R0F3 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sumf1Q8R0F3 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sumf1Q8R0F3 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sumf1Q8R0F3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sumf1Q8R0F3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sumf1Q8R0F3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sumf1Q8R0F3 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sumf1Q8R0F3 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sumf1Q8R0F3 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sumf1Q8R0F3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sumf1Q8R0F3 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sumf1Q8R0F3 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms