Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZT2

Ccsap, Centriole, cilia and spindle-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcsapQ8QZT2 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CcsapQ8QZT2 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CcsapQ8QZT2 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CcsapQ8QZT2 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CcsapQ8QZT2 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CcsapQ8QZT2 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CcsapQ8QZT2 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CcsapQ8QZT2 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CcsapQ8QZT2 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CcsapQ8QZT2 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CcsapQ8QZT2 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CcsapQ8QZT2 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CcsapQ8QZT2 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CcsapQ8QZT2 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CcsapQ8QZT2 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CcsapQ8QZT2 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CcsapQ8QZT2 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CcsapQ8QZT2 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CcsapQ8QZT2 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CcsapQ8QZT2 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CcsapQ8QZT2 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CcsapQ8QZT2 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CcsapQ8QZT2 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CcsapQ8QZT2 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CcsapQ8QZT2 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CcsapQ8QZT2 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CcsapQ8QZT2 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CcsapQ8QZT2 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CcsapQ8QZT2 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CcsapQ8QZT2 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CcsapQ8QZT2 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CcsapQ8QZT2 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CcsapQ8QZT2 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CcsapQ8QZT2 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CcsapQ8QZT2 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CcsapQ8QZT2 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CcsapQ8QZT2 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CcsapQ8QZT2 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CcsapQ8QZT2 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CcsapQ8QZT2 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CcsapQ8QZT2 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CcsapQ8QZT2 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CcsapQ8QZT2 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CcsapQ8QZT2 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CcsapQ8QZT2 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CcsapQ8QZT2 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CcsapQ8QZT2 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CcsapQ8QZT2 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CcsapQ8QZT2 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CcsapQ8QZT2 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CcsapQ8QZT2 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CcsapQ8QZT2 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CcsapQ8QZT2 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CcsapQ8QZT2 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CcsapQ8QZT2 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CcsapQ8QZT2 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CcsapQ8QZT2 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CcsapQ8QZT2 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CcsapQ8QZT2 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CcsapQ8QZT2 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CcsapQ8QZT2 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CcsapQ8QZT2 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CcsapQ8QZT2 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CcsapQ8QZT2 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CcsapQ8QZT2 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CcsapQ8QZT2 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CcsapQ8QZT2 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CcsapQ8QZT2 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CcsapQ8QZT2 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CcsapQ8QZT2 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CcsapQ8QZT2 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CcsapQ8QZT2 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CcsapQ8QZT2 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CcsapQ8QZT2 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CcsapQ8QZT2 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CcsapQ8QZT2 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CcsapQ8QZT2 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CcsapQ8QZT2 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CcsapQ8QZT2 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CcsapQ8QZT2 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CcsapQ8QZT2 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CcsapQ8QZT2 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CcsapQ8QZT2 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CcsapQ8QZT2 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CcsapQ8QZT2 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CcsapQ8QZT2 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CcsapQ8QZT2 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CcsapQ8QZT2 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CcsapQ8QZT2 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CcsapQ8QZT2 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CcsapQ8QZT2 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CcsapQ8QZT2 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CcsapQ8QZT2 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CcsapQ8QZT2 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CcsapQ8QZT2 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CcsapQ8QZT2 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CcsapQ8QZT2 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CcsapQ8QZT2 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CcsapQ8QZT2 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CcsapQ8QZT2 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms