Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZS5

Rnf183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, mousemouse

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Length 190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf183Q8QZS5 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf183Q8QZS5 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf183Q8QZS5 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf183Q8QZS5 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf183Q8QZS5 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf183Q8QZS5 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf183Q8QZS5 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf183Q8QZS5 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf183Q8QZS5 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf183Q8QZS5 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf183Q8QZS5 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf183Q8QZS5 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf183Q8QZS5 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf183Q8QZS5 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf183Q8QZS5 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf183Q8QZS5 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf183Q8QZS5 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf183Q8QZS5 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf183Q8QZS5 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf183Q8QZS5 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf183Q8QZS5 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf183Q8QZS5 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf183Q8QZS5 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf183Q8QZS5 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf183Q8QZS5 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf183Q8QZS5 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf183Q8QZS5 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf183Q8QZS5 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf183Q8QZS5 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf183Q8QZS5 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf183Q8QZS5 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf183Q8QZS5 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf183Q8QZS5 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf183Q8QZS5 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf183Q8QZS5 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf183Q8QZS5 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf183Q8QZS5 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf183Q8QZS5 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf183Q8QZS5 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf183Q8QZS5 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf183Q8QZS5 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf183Q8QZS5 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf183Q8QZS5 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf183Q8QZS5 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf183Q8QZS5 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf183Q8QZS5 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf183Q8QZS5 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf183Q8QZS5 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf183Q8QZS5 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf183Q8QZS5 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf183Q8QZS5 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf183Q8QZS5 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf183Q8QZS5 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Rnf183Q8QZS5 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf183Q8QZS5 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf183Q8QZS5 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf183Q8QZS5 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Rnf183Q8QZS5 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Rnf183Q8QZS5 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Rnf183Q8QZS5 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf183Q8QZS5 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf183Q8QZS5 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf183Q8QZS5 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf183Q8QZS5 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf183Q8QZS5 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf183Q8QZS5 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf183Q8QZS5 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf183Q8QZS5 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf183Q8QZS5 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf183Q8QZS5 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf183Q8QZS5 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf183Q8QZS5 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf183Q8QZS5 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf183Q8QZS5 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf183Q8QZS5 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf183Q8QZS5 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf183Q8QZS5 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf183Q8QZS5 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf183Q8QZS5 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Rnf183Q8QZS5 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf183Q8QZS5 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf183Q8QZS5 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf183Q8QZS5 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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