Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4Z2

Fndc5, Fibronectin type III domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc5Q8K4Z2 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fndc5Q8K4Z2 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fndc5Q8K4Z2 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fndc5Q8K4Z2 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fndc5Q8K4Z2 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fndc5Q8K4Z2 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fndc5Q8K4Z2 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fndc5Q8K4Z2 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fndc5Q8K4Z2 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fndc5Q8K4Z2 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fndc5Q8K4Z2 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fndc5Q8K4Z2 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Fndc5Q8K4Z2 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fndc5Q8K4Z2 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fndc5Q8K4Z2 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Fndc5Q8K4Z2 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fndc5Q8K4Z2 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fndc5Q8K4Z2 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fndc5Q8K4Z2 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fndc5Q8K4Z2 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Fndc5Q8K4Z2 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Fndc5Q8K4Z2 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fndc5Q8K4Z2 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fndc5Q8K4Z2 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fndc5Q8K4Z2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fndc5Q8K4Z2 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fndc5Q8K4Z2 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fndc5Q8K4Z2 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Fndc5Q8K4Z2 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fndc5Q8K4Z2 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Fndc5Q8K4Z2 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fndc5Q8K4Z2 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fndc5Q8K4Z2 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fndc5Q8K4Z2 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fndc5Q8K4Z2 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fndc5Q8K4Z2 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fndc5Q8K4Z2 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fndc5Q8K4Z2 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fndc5Q8K4Z2 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fndc5Q8K4Z2 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fndc5Q8K4Z2 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fndc5Q8K4Z2 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fndc5Q8K4Z2 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fndc5Q8K4Z2 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fndc5Q8K4Z2 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fndc5Q8K4Z2 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fndc5Q8K4Z2 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fndc5Q8K4Z2 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fndc5Q8K4Z2 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fndc5Q8K4Z2 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fndc5Q8K4Z2 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fndc5Q8K4Z2 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fndc5Q8K4Z2 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fndc5Q8K4Z2 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fndc5Q8K4Z2 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fndc5Q8K4Z2 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fndc5Q8K4Z2 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fndc5Q8K4Z2 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fndc5Q8K4Z2 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fndc5Q8K4Z2 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fndc5Q8K4Z2 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fndc5Q8K4Z2 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fndc5Q8K4Z2 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fndc5Q8K4Z2 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fndc5Q8K4Z2 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fndc5Q8K4Z2 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fndc5Q8K4Z2 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fndc5Q8K4Z2 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fndc5Q8K4Z2 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Fndc5Q8K4Z2 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Fndc5Q8K4Z2 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fndc5Q8K4Z2 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Fndc5Q8K4Z2 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fndc5Q8K4Z2 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fndc5Q8K4Z2 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fndc5Q8K4Z2 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fndc5Q8K4Z2 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fndc5Q8K4Z2 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fndc5Q8K4Z2 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fndc5Q8K4Z2 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fndc5Q8K4Z2 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fndc5Q8K4Z2 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fndc5Q8K4Z2 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fndc5Q8K4Z2 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fndc5Q8K4Z2 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fndc5Q8K4Z2 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fndc5Q8K4Z2 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fndc5Q8K4Z2 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fndc5Q8K4Z2 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fndc5Q8K4Z2 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fndc5Q8K4Z2 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fndc5Q8K4Z2 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fndc5Q8K4Z2 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fndc5Q8K4Z2 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fndc5Q8K4Z2 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fndc5Q8K4Z2 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fndc5Q8K4Z2 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Fndc5Q8K4Z2 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fndc5Q8K4Z2 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fndc5Q8K4Z2 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms