Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Hecw1Q8K4P8 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Hecw1Q8K4P8 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Hecw1Q8K4P8 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Hecw1Q8K4P8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Hecw1Q8K4P8 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Hecw1Q8K4P8 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Hecw1Q8K4P8 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
Hecw1Q8K4P8 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Hecw1Q8K4P8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Hecw1Q8K4P8 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Hecw1Q8K4P8 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Hecw1Q8K4P8 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Hecw1Q8K4P8 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Hecw1Q8K4P8 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Hecw1Q8K4P8 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Hecw1Q8K4P8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Hecw1Q8K4P8 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Hecw1Q8K4P8 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Hecw1Q8K4P8 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Hecw1Q8K4P8 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Hecw1Q8K4P8 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Hecw1Q8K4P8 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Hecw1Q8K4P8 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Hecw1Q8K4P8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Hecw1Q8K4P8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Hecw1Q8K4P8 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Hecw1Q8K4P8 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Hecw1Q8K4P8 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Hecw1Q8K4P8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Hecw1Q8K4P8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Hecw1Q8K4P8 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Hecw1Q8K4P8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Hecw1Q8K4P8 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Hecw1Q8K4P8 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Hecw1Q8K4P8 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Hecw1Q8K4P8 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Hecw1Q8K4P8 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Hecw1Q8K4P8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Hecw1Q8K4P8 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Hecw1Q8K4P8 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Hecw1Q8K4P8 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Hecw1Q8K4P8 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Hecw1Q8K4P8 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Hecw1Q8K4P8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Hecw1Q8K4P8 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Hecw1Q8K4P8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Hecw1Q8K4P8 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Hecw1Q8K4P8 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Hecw1Q8K4P8 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Hecw1Q8K4P8 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Hecw1Q8K4P8 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Hecw1Q8K4P8 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Hecw1Q8K4P8 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Hecw1Q8K4P8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Hecw1Q8K4P8 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Hecw1Q8K4P8 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Hecw1Q8K4P8 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Hecw1Q8K4P8 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Hecw1Q8K4P8 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Hecw1Q8K4P8 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Hecw1Q8K4P8 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Hecw1Q8K4P8 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Hecw1Q8K4P8 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Hecw1Q8K4P8 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Hecw1Q8K4P8 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Hecw1Q8K4P8 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Hecw1Q8K4P8 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Hecw1Q8K4P8 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Hecw1Q8K4P8 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Hecw1Q8K4P8 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Hecw1Q8K4P8 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Hecw1Q8K4P8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Hecw1Q8K4P8 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Hecw1Q8K4P8 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Hecw1Q8K4P8 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Hecw1Q8K4P8 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Hecw1Q8K4P8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Hecw1Q8K4P8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Hecw1Q8K4P8 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Hecw1Q8K4P8 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Hecw1Q8K4P8 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Hecw1Q8K4P8 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Hecw1Q8K4P8 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Hecw1Q8K4P8 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Hecw1Q8K4P8 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Hecw1Q8K4P8 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Hecw1Q8K4P8 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Hecw1Q8K4P8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Hecw1Q8K4P8 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Hecw1Q8K4P8 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Hecw1Q8K4P8 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Hecw1Q8K4P8 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Hecw1Q8K4P8 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Hecw1Q8K4P8 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Hecw1Q8K4P8 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Hecw1Q8K4P8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Hecw1Q8K4P8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Hecw1Q8K4P8 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Hecw1Q8K4P8 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms