Protein–RNA interactions for Protein: Q8K449

Abca9, ATP-binding cassette sub-family A member 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abca9Q8K449 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Abca9Q8K449 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Abca9Q8K449 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Abca9Q8K449 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Abca9Q8K449 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Abca9Q8K449 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Abca9Q8K449 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Abca9Q8K449 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Abca9Q8K449 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Abca9Q8K449 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Abca9Q8K449 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Abca9Q8K449 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Abca9Q8K449 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Abca9Q8K449 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Abca9Q8K449 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Abca9Q8K449 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Abca9Q8K449 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Abca9Q8K449 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Abca9Q8K449 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Abca9Q8K449 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Abca9Q8K449 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Abca9Q8K449 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Abca9Q8K449 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Abca9Q8K449 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Abca9Q8K449 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Abca9Q8K449 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Abca9Q8K449 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Abca9Q8K449 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Abca9Q8K449 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Abca9Q8K449 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Abca9Q8K449 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Abca9Q8K449 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Abca9Q8K449 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Abca9Q8K449 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Abca9Q8K449 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Abca9Q8K449 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Abca9Q8K449 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Abca9Q8K449 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Abca9Q8K449 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Abca9Q8K449 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Abca9Q8K449 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Abca9Q8K449 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Abca9Q8K449 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Abca9Q8K449 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Abca9Q8K449 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Abca9Q8K449 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Abca9Q8K449 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Abca9Q8K449 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Abca9Q8K449 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Abca9Q8K449 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Abca9Q8K449 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Abca9Q8K449 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Abca9Q8K449 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Abca9Q8K449 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Abca9Q8K449 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Abca9Q8K449 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Abca9Q8K449 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Abca9Q8K449 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Abca9Q8K449 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Abca9Q8K449 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Abca9Q8K449 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Abca9Q8K449 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Abca9Q8K449 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Abca9Q8K449 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Abca9Q8K449 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Abca9Q8K449 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Abca9Q8K449 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Abca9Q8K449 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Abca9Q8K449 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Abca9Q8K449 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Abca9Q8K449 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Abca9Q8K449 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Abca9Q8K449 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Abca9Q8K449 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Abca9Q8K449 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Abca9Q8K449 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Abca9Q8K449 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Abca9Q8K449 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Abca9Q8K449 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Abca9Q8K449 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Abca9Q8K449 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Abca9Q8K449 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Abca9Q8K449 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Abca9Q8K449 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Abca9Q8K449 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Abca9Q8K449 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Abca9Q8K449 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Abca9Q8K449 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Abca9Q8K449 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Abca9Q8K449 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Abca9Q8K449 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Abca9Q8K449 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Abca9Q8K449 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Abca9Q8K449 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Abca9Q8K449 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Abca9Q8K449 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Abca9Q8K449 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Abca9Q8K449 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Abca9Q8K449 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Abca9Q8K449 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms