Protein–RNA interactions for Protein: Q8K305

Nsl1, Kinetochore-associated protein NSL1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsl1Q8K305 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nsl1Q8K305 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nsl1Q8K305 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Nsl1Q8K305 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Nsl1Q8K305 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nsl1Q8K305 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nsl1Q8K305 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nsl1Q8K305 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nsl1Q8K305 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nsl1Q8K305 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nsl1Q8K305 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nsl1Q8K305 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nsl1Q8K305 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nsl1Q8K305 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nsl1Q8K305 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nsl1Q8K305 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nsl1Q8K305 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nsl1Q8K305 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Nsl1Q8K305 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nsl1Q8K305 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nsl1Q8K305 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nsl1Q8K305 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nsl1Q8K305 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nsl1Q8K305 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nsl1Q8K305 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nsl1Q8K305 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nsl1Q8K305 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nsl1Q8K305 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nsl1Q8K305 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nsl1Q8K305 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nsl1Q8K305 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nsl1Q8K305 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nsl1Q8K305 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nsl1Q8K305 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nsl1Q8K305 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nsl1Q8K305 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nsl1Q8K305 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nsl1Q8K305 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nsl1Q8K305 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nsl1Q8K305 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nsl1Q8K305 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nsl1Q8K305 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nsl1Q8K305 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nsl1Q8K305 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nsl1Q8K305 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nsl1Q8K305 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nsl1Q8K305 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nsl1Q8K305 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nsl1Q8K305 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nsl1Q8K305 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Nsl1Q8K305 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nsl1Q8K305 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nsl1Q8K305 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nsl1Q8K305 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nsl1Q8K305 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nsl1Q8K305 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nsl1Q8K305 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nsl1Q8K305 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nsl1Q8K305 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nsl1Q8K305 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nsl1Q8K305 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nsl1Q8K305 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nsl1Q8K305 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Nsl1Q8K305 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nsl1Q8K305 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nsl1Q8K305 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nsl1Q8K305 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nsl1Q8K305 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nsl1Q8K305 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nsl1Q8K305 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nsl1Q8K305 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Nsl1Q8K305 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nsl1Q8K305 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nsl1Q8K305 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nsl1Q8K305 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nsl1Q8K305 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nsl1Q8K305 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nsl1Q8K305 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nsl1Q8K305 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nsl1Q8K305 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nsl1Q8K305 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nsl1Q8K305 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nsl1Q8K305 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nsl1Q8K305 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Nsl1Q8K305 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nsl1Q8K305 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nsl1Q8K305 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nsl1Q8K305 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nsl1Q8K305 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nsl1Q8K305 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nsl1Q8K305 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nsl1Q8K305 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nsl1Q8K305 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nsl1Q8K305 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nsl1Q8K305 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nsl1Q8K305 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nsl1Q8K305 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nsl1Q8K305 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nsl1Q8K305 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nsl1Q8K305 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms