Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2X2

Rbm48, RNA-binding protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm48Q8K2X2 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbm48Q8K2X2 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbm48Q8K2X2 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rbm48Q8K2X2 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rbm48Q8K2X2 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rbm48Q8K2X2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbm48Q8K2X2 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rbm48Q8K2X2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Rbm48Q8K2X2 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbm48Q8K2X2 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbm48Q8K2X2 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbm48Q8K2X2 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbm48Q8K2X2 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbm48Q8K2X2 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbm48Q8K2X2 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbm48Q8K2X2 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbm48Q8K2X2 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbm48Q8K2X2 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbm48Q8K2X2 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbm48Q8K2X2 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbm48Q8K2X2 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbm48Q8K2X2 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbm48Q8K2X2 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbm48Q8K2X2 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbm48Q8K2X2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbm48Q8K2X2 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbm48Q8K2X2 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbm48Q8K2X2 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbm48Q8K2X2 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbm48Q8K2X2 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbm48Q8K2X2 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbm48Q8K2X2 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbm48Q8K2X2 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbm48Q8K2X2 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbm48Q8K2X2 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbm48Q8K2X2 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbm48Q8K2X2 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbm48Q8K2X2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbm48Q8K2X2 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbm48Q8K2X2 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbm48Q8K2X2 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Rbm48Q8K2X2 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbm48Q8K2X2 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Rbm48Q8K2X2 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbm48Q8K2X2 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbm48Q8K2X2 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Rbm48Q8K2X2 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbm48Q8K2X2 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbm48Q8K2X2 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbm48Q8K2X2 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbm48Q8K2X2 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Rbm48Q8K2X2 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Rbm48Q8K2X2 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Rbm48Q8K2X2 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rbm48Q8K2X2 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rbm48Q8K2X2 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rbm48Q8K2X2 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm48Q8K2X2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm48Q8K2X2 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm48Q8K2X2 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm48Q8K2X2 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm48Q8K2X2 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm48Q8K2X2 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm48Q8K2X2 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm48Q8K2X2 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm48Q8K2X2 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm48Q8K2X2 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm48Q8K2X2 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm48Q8K2X2 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm48Q8K2X2 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm48Q8K2X2 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm48Q8K2X2 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm48Q8K2X2 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm48Q8K2X2 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Rbm48Q8K2X2 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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