Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2T8

Paf1, RNA polymerase II-associated factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paf1Q8K2T8 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Paf1Q8K2T8 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Paf1Q8K2T8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Paf1Q8K2T8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Paf1Q8K2T8 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Paf1Q8K2T8 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Paf1Q8K2T8 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Paf1Q8K2T8 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Paf1Q8K2T8 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Paf1Q8K2T8 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Paf1Q8K2T8 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Paf1Q8K2T8 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Paf1Q8K2T8 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Paf1Q8K2T8 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Paf1Q8K2T8 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Paf1Q8K2T8 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Paf1Q8K2T8 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Paf1Q8K2T8 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Paf1Q8K2T8 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Paf1Q8K2T8 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Paf1Q8K2T8 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Paf1Q8K2T8 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Paf1Q8K2T8 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Paf1Q8K2T8 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Paf1Q8K2T8 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Paf1Q8K2T8 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Paf1Q8K2T8 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Paf1Q8K2T8 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Paf1Q8K2T8 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Paf1Q8K2T8 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Paf1Q8K2T8 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Paf1Q8K2T8 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Paf1Q8K2T8 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Paf1Q8K2T8 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Paf1Q8K2T8 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Paf1Q8K2T8 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Paf1Q8K2T8 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Paf1Q8K2T8 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Paf1Q8K2T8 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Paf1Q8K2T8 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Paf1Q8K2T8 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Paf1Q8K2T8 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Paf1Q8K2T8 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Paf1Q8K2T8 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Paf1Q8K2T8 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Paf1Q8K2T8 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Paf1Q8K2T8 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Paf1Q8K2T8 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Paf1Q8K2T8 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Paf1Q8K2T8 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Paf1Q8K2T8 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Paf1Q8K2T8 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Paf1Q8K2T8 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Paf1Q8K2T8 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Paf1Q8K2T8 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Paf1Q8K2T8 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Paf1Q8K2T8 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Paf1Q8K2T8 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Paf1Q8K2T8 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Paf1Q8K2T8 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Paf1Q8K2T8 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Paf1Q8K2T8 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Paf1Q8K2T8 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Paf1Q8K2T8 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Paf1Q8K2T8 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Paf1Q8K2T8 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Paf1Q8K2T8 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Paf1Q8K2T8 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Paf1Q8K2T8 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Paf1Q8K2T8 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Paf1Q8K2T8 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Paf1Q8K2T8 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Paf1Q8K2T8 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Paf1Q8K2T8 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Paf1Q8K2T8 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Paf1Q8K2T8 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Paf1Q8K2T8 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Paf1Q8K2T8 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Paf1Q8K2T8 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Paf1Q8K2T8 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Paf1Q8K2T8 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Paf1Q8K2T8 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Paf1Q8K2T8 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Paf1Q8K2T8 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Paf1Q8K2T8 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Paf1Q8K2T8 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Paf1Q8K2T8 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Paf1Q8K2T8 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Paf1Q8K2T8 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Paf1Q8K2T8 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Paf1Q8K2T8 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Paf1Q8K2T8 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Paf1Q8K2T8 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Paf1Q8K2T8 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Paf1Q8K2T8 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Paf1Q8K2T8 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Paf1Q8K2T8 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Paf1Q8K2T8 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Paf1Q8K2T8 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Paf1Q8K2T8 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms