Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Q0

Commd9, COMM domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd9Q8K2Q0 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Commd9Q8K2Q0 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Commd9Q8K2Q0 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Commd9Q8K2Q0 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Commd9Q8K2Q0 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Commd9Q8K2Q0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Commd9Q8K2Q0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Commd9Q8K2Q0 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Commd9Q8K2Q0 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Commd9Q8K2Q0 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Commd9Q8K2Q0 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Commd9Q8K2Q0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Commd9Q8K2Q0 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Commd9Q8K2Q0 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Commd9Q8K2Q0 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Commd9Q8K2Q0 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Commd9Q8K2Q0 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Commd9Q8K2Q0 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Commd9Q8K2Q0 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Commd9Q8K2Q0 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Commd9Q8K2Q0 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Commd9Q8K2Q0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Commd9Q8K2Q0 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Commd9Q8K2Q0 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Commd9Q8K2Q0 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Commd9Q8K2Q0 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Commd9Q8K2Q0 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Commd9Q8K2Q0 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Commd9Q8K2Q0 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Commd9Q8K2Q0 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Commd9Q8K2Q0 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Commd9Q8K2Q0 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Commd9Q8K2Q0 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Commd9Q8K2Q0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Commd9Q8K2Q0 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Commd9Q8K2Q0 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Commd9Q8K2Q0 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Commd9Q8K2Q0 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Commd9Q8K2Q0 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Commd9Q8K2Q0 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Commd9Q8K2Q0 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Commd9Q8K2Q0 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Commd9Q8K2Q0 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Commd9Q8K2Q0 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Commd9Q8K2Q0 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Commd9Q8K2Q0 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Commd9Q8K2Q0 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Commd9Q8K2Q0 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Commd9Q8K2Q0 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Commd9Q8K2Q0 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Commd9Q8K2Q0 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Commd9Q8K2Q0 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Commd9Q8K2Q0 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Commd9Q8K2Q0 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Commd9Q8K2Q0 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Commd9Q8K2Q0 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Commd9Q8K2Q0 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Commd9Q8K2Q0 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Commd9Q8K2Q0 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Commd9Q8K2Q0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Commd9Q8K2Q0 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Commd9Q8K2Q0 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Commd9Q8K2Q0 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Commd9Q8K2Q0 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Commd9Q8K2Q0 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Commd9Q8K2Q0 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Commd9Q8K2Q0 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Commd9Q8K2Q0 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Commd9Q8K2Q0 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Commd9Q8K2Q0 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Commd9Q8K2Q0 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Commd9Q8K2Q0 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Commd9Q8K2Q0 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Commd9Q8K2Q0 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Commd9Q8K2Q0 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Commd9Q8K2Q0 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Commd9Q8K2Q0 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Commd9Q8K2Q0 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Commd9Q8K2Q0 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Commd9Q8K2Q0 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Commd9Q8K2Q0 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Commd9Q8K2Q0 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Commd9Q8K2Q0 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Commd9Q8K2Q0 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Commd9Q8K2Q0 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Commd9Q8K2Q0 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Commd9Q8K2Q0 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Commd9Q8K2Q0 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Commd9Q8K2Q0 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Commd9Q8K2Q0 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Commd9Q8K2Q0 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Commd9Q8K2Q0 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Commd9Q8K2Q0 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Commd9Q8K2Q0 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Commd9Q8K2Q0 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Commd9Q8K2Q0 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Commd9Q8K2Q0 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Commd9Q8K2Q0 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Commd9Q8K2Q0 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Commd9Q8K2Q0 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.9 ms