Protein–RNA interactions for Protein: Q8K249

Cd300e, CMRF35-like molecule 2, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300eQ8K249 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd300eQ8K249 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
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Cd300eQ8K249 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd300eQ8K249 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd300eQ8K249 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd300eQ8K249 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cd300eQ8K249 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cd300eQ8K249 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cd300eQ8K249 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cd300eQ8K249 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd300eQ8K249 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd300eQ8K249 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd300eQ8K249 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd300eQ8K249 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd300eQ8K249 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd300eQ8K249 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd300eQ8K249 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd300eQ8K249 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd300eQ8K249 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd300eQ8K249 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd300eQ8K249 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd300eQ8K249 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd300eQ8K249 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd300eQ8K249 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd300eQ8K249 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd300eQ8K249 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd300eQ8K249 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd300eQ8K249 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd300eQ8K249 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd300eQ8K249 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd300eQ8K249 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd300eQ8K249 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd300eQ8K249 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd300eQ8K249 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd300eQ8K249 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd300eQ8K249 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd300eQ8K249 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd300eQ8K249 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd300eQ8K249 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd300eQ8K249 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd300eQ8K249 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd300eQ8K249 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd300eQ8K249 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd300eQ8K249 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd300eQ8K249 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd300eQ8K249 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd300eQ8K249 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd300eQ8K249 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd300eQ8K249 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd300eQ8K249 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Cd300eQ8K249 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd300eQ8K249 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd300eQ8K249 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd300eQ8K249 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd300eQ8K249 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd300eQ8K249 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd300eQ8K249 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Cd300eQ8K249 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd300eQ8K249 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd300eQ8K249 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd300eQ8K249 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd300eQ8K249 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd300eQ8K249 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd300eQ8K249 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd300eQ8K249 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd300eQ8K249 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd300eQ8K249 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd300eQ8K249 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd300eQ8K249 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd300eQ8K249 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd300eQ8K249 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd300eQ8K249 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd300eQ8K249 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd300eQ8K249 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd300eQ8K249 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd300eQ8K249 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd300eQ8K249 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd300eQ8K249 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd300eQ8K249 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd300eQ8K249 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd300eQ8K249 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd300eQ8K249 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd300eQ8K249 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd300eQ8K249 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd300eQ8K249 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd300eQ8K249 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd300eQ8K249 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd300eQ8K249 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd300eQ8K249 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd300eQ8K249 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd300eQ8K249 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms