Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R7

Nek9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, mousemouse

Predictions only

Length 984 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek9Q8K1R7 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nek9Q8K1R7 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Nek9Q8K1R7 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Nek9Q8K1R7 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Nek9Q8K1R7 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Nek9Q8K1R7 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Nek9Q8K1R7 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Nek9Q8K1R7 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nek9Q8K1R7 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nek9Q8K1R7 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nek9Q8K1R7 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nek9Q8K1R7 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nek9Q8K1R7 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nek9Q8K1R7 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nek9Q8K1R7 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nek9Q8K1R7 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nek9Q8K1R7 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nek9Q8K1R7 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nek9Q8K1R7 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nek9Q8K1R7 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nek9Q8K1R7 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nek9Q8K1R7 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nek9Q8K1R7 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nek9Q8K1R7 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nek9Q8K1R7 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nek9Q8K1R7 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nek9Q8K1R7 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nek9Q8K1R7 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nek9Q8K1R7 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nek9Q8K1R7 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nek9Q8K1R7 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nek9Q8K1R7 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nek9Q8K1R7 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nek9Q8K1R7 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nek9Q8K1R7 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nek9Q8K1R7 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nek9Q8K1R7 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nek9Q8K1R7 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nek9Q8K1R7 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nek9Q8K1R7 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nek9Q8K1R7 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nek9Q8K1R7 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nek9Q8K1R7 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Nek9Q8K1R7 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nek9Q8K1R7 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nek9Q8K1R7 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nek9Q8K1R7 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nek9Q8K1R7 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nek9Q8K1R7 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nek9Q8K1R7 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nek9Q8K1R7 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nek9Q8K1R7 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nek9Q8K1R7 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nek9Q8K1R7 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nek9Q8K1R7 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nek9Q8K1R7 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nek9Q8K1R7 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nek9Q8K1R7 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nek9Q8K1R7 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nek9Q8K1R7 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nek9Q8K1R7 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nek9Q8K1R7 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Nek9Q8K1R7 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nek9Q8K1R7 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nek9Q8K1R7 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nek9Q8K1R7 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nek9Q8K1R7 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nek9Q8K1R7 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Nek9Q8K1R7 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Nek9Q8K1R7 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nek9Q8K1R7 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nek9Q8K1R7 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nek9Q8K1R7 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nek9Q8K1R7 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nek9Q8K1R7 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nek9Q8K1R7 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nek9Q8K1R7 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nek9Q8K1R7 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nek9Q8K1R7 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nek9Q8K1R7 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nek9Q8K1R7 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nek9Q8K1R7 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Nek9Q8K1R7 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nek9Q8K1R7 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nek9Q8K1R7 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Nek9Q8K1R7 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nek9Q8K1R7 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nek9Q8K1R7 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nek9Q8K1R7 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nek9Q8K1R7 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nek9Q8K1R7 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nek9Q8K1R7 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nek9Q8K1R7 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nek9Q8K1R7 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nek9Q8K1R7 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Nek9Q8K1R7 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nek9Q8K1R7 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nek9Q8K1R7 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nek9Q8K1R7 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nek9Q8K1R7 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms