Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sde2Q8K1J5 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sde2Q8K1J5 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sde2Q8K1J5 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sde2Q8K1J5 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sde2Q8K1J5 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sde2Q8K1J5 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Sde2Q8K1J5 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sde2Q8K1J5 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sde2Q8K1J5 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sde2Q8K1J5 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sde2Q8K1J5 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sde2Q8K1J5 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sde2Q8K1J5 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sde2Q8K1J5 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sde2Q8K1J5 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sde2Q8K1J5 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sde2Q8K1J5 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sde2Q8K1J5 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sde2Q8K1J5 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Sde2Q8K1J5 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sde2Q8K1J5 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sde2Q8K1J5 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sde2Q8K1J5 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sde2Q8K1J5 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sde2Q8K1J5 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sde2Q8K1J5 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sde2Q8K1J5 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sde2Q8K1J5 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sde2Q8K1J5 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sde2Q8K1J5 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sde2Q8K1J5 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sde2Q8K1J5 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sde2Q8K1J5 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sde2Q8K1J5 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sde2Q8K1J5 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sde2Q8K1J5 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Sde2Q8K1J5 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sde2Q8K1J5 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sde2Q8K1J5 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sde2Q8K1J5 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Sde2Q8K1J5 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sde2Q8K1J5 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sde2Q8K1J5 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sde2Q8K1J5 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sde2Q8K1J5 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sde2Q8K1J5 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sde2Q8K1J5 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sde2Q8K1J5 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sde2Q8K1J5 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sde2Q8K1J5 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sde2Q8K1J5 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sde2Q8K1J5 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sde2Q8K1J5 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sde2Q8K1J5 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sde2Q8K1J5 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sde2Q8K1J5 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sde2Q8K1J5 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sde2Q8K1J5 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sde2Q8K1J5 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Sde2Q8K1J5 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sde2Q8K1J5 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sde2Q8K1J5 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Sde2Q8K1J5 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sde2Q8K1J5 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sde2Q8K1J5 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sde2Q8K1J5 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sde2Q8K1J5 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Sde2Q8K1J5 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sde2Q8K1J5 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sde2Q8K1J5 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sde2Q8K1J5 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sde2Q8K1J5 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sde2Q8K1J5 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sde2Q8K1J5 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sde2Q8K1J5 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sde2Q8K1J5 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sde2Q8K1J5 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sde2Q8K1J5 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Sde2Q8K1J5 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sde2Q8K1J5 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sde2Q8K1J5 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sde2Q8K1J5 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sde2Q8K1J5 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sde2Q8K1J5 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sde2Q8K1J5 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Sde2Q8K1J5 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sde2Q8K1J5 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sde2Q8K1J5 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sde2Q8K1J5 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sde2Q8K1J5 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sde2Q8K1J5 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sde2Q8K1J5 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sde2Q8K1J5 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sde2Q8K1J5 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sde2Q8K1J5 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sde2Q8K1J5 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sde2Q8K1J5 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sde2Q8K1J5 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sde2Q8K1J5 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms