Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E8

Fgb, Fibrinogen beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgbQ8K0E8 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FgbQ8K0E8 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FgbQ8K0E8 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FgbQ8K0E8 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FgbQ8K0E8 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FgbQ8K0E8 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FgbQ8K0E8 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FgbQ8K0E8 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FgbQ8K0E8 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FgbQ8K0E8 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FgbQ8K0E8 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FgbQ8K0E8 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FgbQ8K0E8 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FgbQ8K0E8 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FgbQ8K0E8 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FgbQ8K0E8 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FgbQ8K0E8 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FgbQ8K0E8 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FgbQ8K0E8 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FgbQ8K0E8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
FgbQ8K0E8 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FgbQ8K0E8 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FgbQ8K0E8 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FgbQ8K0E8 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
FgbQ8K0E8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FgbQ8K0E8 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FgbQ8K0E8 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FgbQ8K0E8 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FgbQ8K0E8 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FgbQ8K0E8 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FgbQ8K0E8 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FgbQ8K0E8 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FgbQ8K0E8 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FgbQ8K0E8 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FgbQ8K0E8 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FgbQ8K0E8 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FgbQ8K0E8 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FgbQ8K0E8 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FgbQ8K0E8 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FgbQ8K0E8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FgbQ8K0E8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
FgbQ8K0E8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FgbQ8K0E8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
FgbQ8K0E8 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FgbQ8K0E8 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FgbQ8K0E8 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FgbQ8K0E8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FgbQ8K0E8 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
FgbQ8K0E8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FgbQ8K0E8 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FgbQ8K0E8 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FgbQ8K0E8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
FgbQ8K0E8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
FgbQ8K0E8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FgbQ8K0E8 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
FgbQ8K0E8 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FgbQ8K0E8 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
FgbQ8K0E8 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FgbQ8K0E8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FgbQ8K0E8 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FgbQ8K0E8 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FgbQ8K0E8 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FgbQ8K0E8 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FgbQ8K0E8 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
FgbQ8K0E8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
FgbQ8K0E8 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
FgbQ8K0E8 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FgbQ8K0E8 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FgbQ8K0E8 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FgbQ8K0E8 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FgbQ8K0E8 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FgbQ8K0E8 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
FgbQ8K0E8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FgbQ8K0E8 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FgbQ8K0E8 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
FgbQ8K0E8 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
FgbQ8K0E8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FgbQ8K0E8 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FgbQ8K0E8 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FgbQ8K0E8 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FgbQ8K0E8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FgbQ8K0E8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FgbQ8K0E8 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FgbQ8K0E8 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FgbQ8K0E8 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FgbQ8K0E8 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FgbQ8K0E8 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
FgbQ8K0E8 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FgbQ8K0E8 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FgbQ8K0E8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FgbQ8K0E8 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FgbQ8K0E8 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FgbQ8K0E8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FgbQ8K0E8 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FgbQ8K0E8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FgbQ8K0E8 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FgbQ8K0E8 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FgbQ8K0E8 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FgbQ8K0E8 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FgbQ8K0E8 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms