Protein–RNA interactions for Protein: Q8K039

Uncharacterized protein KIAA1143 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8K039 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q8K039 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q8K039 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q8K039 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q8K039 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q8K039 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q8K039 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q8K039 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q8K039 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q8K039 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Q8K039 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q8K039 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q8K039 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q8K039 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q8K039 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q8K039 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q8K039 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q8K039 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q8K039 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q8K039 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Q8K039 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Q8K039 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q8K039 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q8K039 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q8K039 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q8K039 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q8K039 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q8K039 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q8K039 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q8K039 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q8K039 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q8K039 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q8K039 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q8K039 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q8K039 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Q8K039 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q8K039 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q8K039 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q8K039 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q8K039 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q8K039 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q8K039 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q8K039 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q8K039 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q8K039 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q8K039 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Q8K039 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Q8K039 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Q8K039 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Q8K039 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q8K039 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q8K039 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q8K039 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q8K039 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q8K039 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q8K039 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q8K039 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q8K039 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q8K039 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q8K039 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q8K039 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q8K039 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q8K039 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q8K039 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q8K039 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q8K039 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q8K039 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q8K039 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q8K039 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q8K039 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q8K039 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q8K039 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q8K039 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q8K039 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q8K039 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q8K039 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q8K039 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q8K039 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q8K039 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q8K039 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q8K039 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q8K039 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q8K039 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q8K039 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q8K039 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q8K039 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Q8K039 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q8K039 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q8K039 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q8K039 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q8K039 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q8K039 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q8K039 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q8K039 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q8K039 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q8K039 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q8K039 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q8K039 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q8K039 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q8K039 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms