Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZR6

Slc4a8, Electroneutral sodium bicarbonate exchanger 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc4a8Q8JZR6 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc4a8Q8JZR6 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc4a8Q8JZR6 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc4a8Q8JZR6 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc4a8Q8JZR6 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc4a8Q8JZR6 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc4a8Q8JZR6 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc4a8Q8JZR6 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc4a8Q8JZR6 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc4a8Q8JZR6 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc4a8Q8JZR6 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc4a8Q8JZR6 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc4a8Q8JZR6 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc4a8Q8JZR6 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc4a8Q8JZR6 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc4a8Q8JZR6 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc4a8Q8JZR6 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc4a8Q8JZR6 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc4a8Q8JZR6 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc4a8Q8JZR6 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc4a8Q8JZR6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc4a8Q8JZR6 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc4a8Q8JZR6 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc4a8Q8JZR6 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc4a8Q8JZR6 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc4a8Q8JZR6 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc4a8Q8JZR6 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc4a8Q8JZR6 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Slc4a8Q8JZR6 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Slc4a8Q8JZR6 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Slc4a8Q8JZR6 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Slc4a8Q8JZR6 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Slc4a8Q8JZR6 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Slc4a8Q8JZR6 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Slc4a8Q8JZR6 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Slc4a8Q8JZR6 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc4a8Q8JZR6 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc4a8Q8JZR6 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc4a8Q8JZR6 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc4a8Q8JZR6 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc4a8Q8JZR6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc4a8Q8JZR6 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc4a8Q8JZR6 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc4a8Q8JZR6 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc4a8Q8JZR6 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc4a8Q8JZR6 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc4a8Q8JZR6 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc4a8Q8JZR6 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc4a8Q8JZR6 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc4a8Q8JZR6 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc4a8Q8JZR6 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc4a8Q8JZR6 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc4a8Q8JZR6 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc4a8Q8JZR6 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc4a8Q8JZR6 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc4a8Q8JZR6 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc4a8Q8JZR6 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc4a8Q8JZR6 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc4a8Q8JZR6 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc4a8Q8JZR6 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc4a8Q8JZR6 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc4a8Q8JZR6 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc4a8Q8JZR6 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc4a8Q8JZR6 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc4a8Q8JZR6 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc4a8Q8JZR6 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc4a8Q8JZR6 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc4a8Q8JZR6 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc4a8Q8JZR6 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc4a8Q8JZR6 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc4a8Q8JZR6 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc4a8Q8JZR6 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc4a8Q8JZR6 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc4a8Q8JZR6 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc4a8Q8JZR6 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc4a8Q8JZR6 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc4a8Q8JZR6 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc4a8Q8JZR6 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc4a8Q8JZR6 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc4a8Q8JZR6 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc4a8Q8JZR6 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc4a8Q8JZR6 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Slc4a8Q8JZR6 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Slc4a8Q8JZR6 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Slc4a8Q8JZR6 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Slc4a8Q8JZR6 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Slc4a8Q8JZR6 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Slc4a8Q8JZR6 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Slc4a8Q8JZR6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Slc4a8Q8JZR6 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc4a8Q8JZR6 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc4a8Q8JZR6 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc4a8Q8JZR6 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc4a8Q8JZR6 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc4a8Q8JZR6 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc4a8Q8JZR6 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc4a8Q8JZR6 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc4a8Q8JZR6 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc4a8Q8JZR6 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc4a8Q8JZR6 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms