Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip3Q8CHD8 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Rab11fip3Q8CHD8 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rab11fip3Q8CHD8 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rab11fip3Q8CHD8 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rab11fip3Q8CHD8 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rab11fip3Q8CHD8 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rab11fip3Q8CHD8 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rab11fip3Q8CHD8 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rab11fip3Q8CHD8 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Rab11fip3Q8CHD8 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rab11fip3Q8CHD8 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rab11fip3Q8CHD8 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rab11fip3Q8CHD8 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rab11fip3Q8CHD8 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rab11fip3Q8CHD8 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rab11fip3Q8CHD8 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Rab11fip3Q8CHD8 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Rab11fip3Q8CHD8 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Rab11fip3Q8CHD8 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Rab11fip3Q8CHD8 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rab11fip3Q8CHD8 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rab11fip3Q8CHD8 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rab11fip3Q8CHD8 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rab11fip3Q8CHD8 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rab11fip3Q8CHD8 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rab11fip3Q8CHD8 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rab11fip3Q8CHD8 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rab11fip3Q8CHD8 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rab11fip3Q8CHD8 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rab11fip3Q8CHD8 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rab11fip3Q8CHD8 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rab11fip3Q8CHD8 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rab11fip3Q8CHD8 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rab11fip3Q8CHD8 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rab11fip3Q8CHD8 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rab11fip3Q8CHD8 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rab11fip3Q8CHD8 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rab11fip3Q8CHD8 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rab11fip3Q8CHD8 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Rab11fip3Q8CHD8 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rab11fip3Q8CHD8 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rab11fip3Q8CHD8 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rab11fip3Q8CHD8 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rab11fip3Q8CHD8 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rab11fip3Q8CHD8 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rab11fip3Q8CHD8 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Rab11fip3Q8CHD8 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Rab11fip3Q8CHD8 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rab11fip3Q8CHD8 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rab11fip3Q8CHD8 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rab11fip3Q8CHD8 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rab11fip3Q8CHD8 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rab11fip3Q8CHD8 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Rab11fip3Q8CHD8 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rab11fip3Q8CHD8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rab11fip3Q8CHD8 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rab11fip3Q8CHD8 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rab11fip3Q8CHD8 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rab11fip3Q8CHD8 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rab11fip3Q8CHD8 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rab11fip3Q8CHD8 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rab11fip3Q8CHD8 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rab11fip3Q8CHD8 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rab11fip3Q8CHD8 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rab11fip3Q8CHD8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rab11fip3Q8CHD8 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rab11fip3Q8CHD8 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rab11fip3Q8CHD8 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rab11fip3Q8CHD8 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rab11fip3Q8CHD8 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Rab11fip3Q8CHD8 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rab11fip3Q8CHD8 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rab11fip3Q8CHD8 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rab11fip3Q8CHD8 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rab11fip3Q8CHD8 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rab11fip3Q8CHD8 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rab11fip3Q8CHD8 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rab11fip3Q8CHD8 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rab11fip3Q8CHD8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rab11fip3Q8CHD8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rab11fip3Q8CHD8 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rab11fip3Q8CHD8 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rab11fip3Q8CHD8 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rab11fip3Q8CHD8 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rab11fip3Q8CHD8 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rab11fip3Q8CHD8 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rab11fip3Q8CHD8 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Rab11fip3Q8CHD8 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rab11fip3Q8CHD8 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rab11fip3Q8CHD8 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rab11fip3Q8CHD8 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rab11fip3Q8CHD8 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rab11fip3Q8CHD8 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rab11fip3Q8CHD8 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rab11fip3Q8CHD8 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rab11fip3Q8CHD8 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rab11fip3Q8CHD8 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rab11fip3Q8CHD8 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rab11fip3Q8CHD8 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rab11fip3Q8CHD8 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
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