Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGR7

Upp2, Uridine phosphorylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp2Q8CGR7 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Upp2Q8CGR7 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Upp2Q8CGR7 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Upp2Q8CGR7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Upp2Q8CGR7 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Upp2Q8CGR7 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Upp2Q8CGR7 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Upp2Q8CGR7 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Upp2Q8CGR7 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Upp2Q8CGR7 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Upp2Q8CGR7 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Upp2Q8CGR7 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Upp2Q8CGR7 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Upp2Q8CGR7 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Upp2Q8CGR7 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Upp2Q8CGR7 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Upp2Q8CGR7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Upp2Q8CGR7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Upp2Q8CGR7 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Upp2Q8CGR7 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Upp2Q8CGR7 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Upp2Q8CGR7 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Upp2Q8CGR7 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Upp2Q8CGR7 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Upp2Q8CGR7 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Upp2Q8CGR7 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Upp2Q8CGR7 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Upp2Q8CGR7 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Upp2Q8CGR7 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Upp2Q8CGR7 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Upp2Q8CGR7 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Upp2Q8CGR7 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Upp2Q8CGR7 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Upp2Q8CGR7 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Upp2Q8CGR7 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Upp2Q8CGR7 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Upp2Q8CGR7 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Upp2Q8CGR7 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Upp2Q8CGR7 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Upp2Q8CGR7 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Upp2Q8CGR7 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Upp2Q8CGR7 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Upp2Q8CGR7 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Upp2Q8CGR7 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Upp2Q8CGR7 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Upp2Q8CGR7 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Upp2Q8CGR7 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Upp2Q8CGR7 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Upp2Q8CGR7 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Upp2Q8CGR7 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Upp2Q8CGR7 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Upp2Q8CGR7 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Upp2Q8CGR7 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Upp2Q8CGR7 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Upp2Q8CGR7 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Upp2Q8CGR7 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Upp2Q8CGR7 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Upp2Q8CGR7 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Upp2Q8CGR7 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Upp2Q8CGR7 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Upp2Q8CGR7 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Upp2Q8CGR7 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Upp2Q8CGR7 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Upp2Q8CGR7 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Upp2Q8CGR7 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Upp2Q8CGR7 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Upp2Q8CGR7 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Upp2Q8CGR7 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Upp2Q8CGR7 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Upp2Q8CGR7 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Upp2Q8CGR7 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Upp2Q8CGR7 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Upp2Q8CGR7 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Upp2Q8CGR7 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Upp2Q8CGR7 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Upp2Q8CGR7 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Upp2Q8CGR7 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Upp2Q8CGR7 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Upp2Q8CGR7 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Upp2Q8CGR7 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Upp2Q8CGR7 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Upp2Q8CGR7 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Upp2Q8CGR7 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Upp2Q8CGR7 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Upp2Q8CGR7 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Upp2Q8CGR7 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Upp2Q8CGR7 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Upp2Q8CGR7 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Upp2Q8CGR7 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Upp2Q8CGR7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Upp2Q8CGR7 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Upp2Q8CGR7 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Upp2Q8CGR7 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Upp2Q8CGR7 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Upp2Q8CGR7 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Upp2Q8CGR7 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Upp2Q8CGR7 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Upp2Q8CGR7 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Upp2Q8CGR7 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Upp2Q8CGR7 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms