Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGC6

Rbm28, RNA-binding protein 28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm28Q8CGC6 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rbm28Q8CGC6 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rbm28Q8CGC6 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rbm28Q8CGC6 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rbm28Q8CGC6 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rbm28Q8CGC6 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rbm28Q8CGC6 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rbm28Q8CGC6 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rbm28Q8CGC6 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rbm28Q8CGC6 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rbm28Q8CGC6 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rbm28Q8CGC6 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rbm28Q8CGC6 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rbm28Q8CGC6 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rbm28Q8CGC6 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rbm28Q8CGC6 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rbm28Q8CGC6 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rbm28Q8CGC6 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rbm28Q8CGC6 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rbm28Q8CGC6 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rbm28Q8CGC6 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rbm28Q8CGC6 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rbm28Q8CGC6 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rbm28Q8CGC6 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rbm28Q8CGC6 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rbm28Q8CGC6 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rbm28Q8CGC6 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Rbm28Q8CGC6 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rbm28Q8CGC6 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rbm28Q8CGC6 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rbm28Q8CGC6 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rbm28Q8CGC6 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rbm28Q8CGC6 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rbm28Q8CGC6 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rbm28Q8CGC6 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rbm28Q8CGC6 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rbm28Q8CGC6 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rbm28Q8CGC6 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rbm28Q8CGC6 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rbm28Q8CGC6 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rbm28Q8CGC6 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rbm28Q8CGC6 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rbm28Q8CGC6 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rbm28Q8CGC6 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rbm28Q8CGC6 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rbm28Q8CGC6 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rbm28Q8CGC6 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rbm28Q8CGC6 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Rbm28Q8CGC6 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rbm28Q8CGC6 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rbm28Q8CGC6 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rbm28Q8CGC6 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rbm28Q8CGC6 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rbm28Q8CGC6 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rbm28Q8CGC6 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rbm28Q8CGC6 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rbm28Q8CGC6 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rbm28Q8CGC6 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rbm28Q8CGC6 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rbm28Q8CGC6 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rbm28Q8CGC6 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rbm28Q8CGC6 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rbm28Q8CGC6 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rbm28Q8CGC6 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rbm28Q8CGC6 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rbm28Q8CGC6 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rbm28Q8CGC6 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rbm28Q8CGC6 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rbm28Q8CGC6 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rbm28Q8CGC6 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rbm28Q8CGC6 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rbm28Q8CGC6 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rbm28Q8CGC6 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Rbm28Q8CGC6 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Rbm28Q8CGC6 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Rbm28Q8CGC6 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rbm28Q8CGC6 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rbm28Q8CGC6 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rbm28Q8CGC6 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rbm28Q8CGC6 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rbm28Q8CGC6 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rbm28Q8CGC6 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rbm28Q8CGC6 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rbm28Q8CGC6 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rbm28Q8CGC6 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rbm28Q8CGC6 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rbm28Q8CGC6 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rbm28Q8CGC6 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rbm28Q8CGC6 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rbm28Q8CGC6 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rbm28Q8CGC6 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rbm28Q8CGC6 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rbm28Q8CGC6 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rbm28Q8CGC6 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Rbm28Q8CGC6 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rbm28Q8CGC6 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rbm28Q8CGC6 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rbm28Q8CGC6 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rbm28Q8CGC6 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rbm28Q8CGC6 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
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