Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGB3

Uaca, Uveal autoantigen with coiled-coil domains and ankyrin repeats, mousemouse

Predictions only

Length 1,411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UacaQ8CGB3 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
UacaQ8CGB3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
UacaQ8CGB3 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
UacaQ8CGB3 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
UacaQ8CGB3 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
UacaQ8CGB3 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
UacaQ8CGB3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
UacaQ8CGB3 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
UacaQ8CGB3 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
UacaQ8CGB3 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
UacaQ8CGB3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
UacaQ8CGB3 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
UacaQ8CGB3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
UacaQ8CGB3 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
UacaQ8CGB3 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
UacaQ8CGB3 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
UacaQ8CGB3 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
UacaQ8CGB3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
UacaQ8CGB3 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
UacaQ8CGB3 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
UacaQ8CGB3 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
UacaQ8CGB3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
UacaQ8CGB3 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
UacaQ8CGB3 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
UacaQ8CGB3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
UacaQ8CGB3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
UacaQ8CGB3 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
UacaQ8CGB3 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
UacaQ8CGB3 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
UacaQ8CGB3 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
UacaQ8CGB3 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
UacaQ8CGB3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
UacaQ8CGB3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
UacaQ8CGB3 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
UacaQ8CGB3 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
UacaQ8CGB3 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
UacaQ8CGB3 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
UacaQ8CGB3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
UacaQ8CGB3 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
UacaQ8CGB3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
UacaQ8CGB3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
UacaQ8CGB3 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
UacaQ8CGB3 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
UacaQ8CGB3 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
UacaQ8CGB3 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
UacaQ8CGB3 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
UacaQ8CGB3 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
UacaQ8CGB3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
UacaQ8CGB3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
UacaQ8CGB3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
UacaQ8CGB3 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
UacaQ8CGB3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
UacaQ8CGB3 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
UacaQ8CGB3 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
UacaQ8CGB3 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
UacaQ8CGB3 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
UacaQ8CGB3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
UacaQ8CGB3 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
UacaQ8CGB3 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
UacaQ8CGB3 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
UacaQ8CGB3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
UacaQ8CGB3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
UacaQ8CGB3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
UacaQ8CGB3 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
UacaQ8CGB3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
UacaQ8CGB3 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
UacaQ8CGB3 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
UacaQ8CGB3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
UacaQ8CGB3 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
UacaQ8CGB3 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
UacaQ8CGB3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
UacaQ8CGB3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
UacaQ8CGB3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
UacaQ8CGB3 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
UacaQ8CGB3 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
UacaQ8CGB3 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
UacaQ8CGB3 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
UacaQ8CGB3 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
UacaQ8CGB3 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
UacaQ8CGB3 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
UacaQ8CGB3 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
UacaQ8CGB3 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
UacaQ8CGB3 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
UacaQ8CGB3 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
UacaQ8CGB3 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
UacaQ8CGB3 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
UacaQ8CGB3 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
UacaQ8CGB3 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
UacaQ8CGB3 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
UacaQ8CGB3 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
UacaQ8CGB3 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
UacaQ8CGB3 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
UacaQ8CGB3 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
UacaQ8CGB3 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
UacaQ8CGB3 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
UacaQ8CGB3 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
UacaQ8CGB3 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
UacaQ8CGB3 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
UacaQ8CGB3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
UacaQ8CGB3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms