Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFT2

Setd1b, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd1bQ8CFT2 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Setd1bQ8CFT2 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Setd1bQ8CFT2 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Setd1bQ8CFT2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
Setd1bQ8CFT2 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Setd1bQ8CFT2 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
Setd1bQ8CFT2 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Setd1bQ8CFT2 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
Setd1bQ8CFT2 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
Setd1bQ8CFT2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Setd1bQ8CFT2 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Setd1bQ8CFT2 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Setd1bQ8CFT2 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Setd1bQ8CFT2 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Setd1bQ8CFT2 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Setd1bQ8CFT2 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Setd1bQ8CFT2 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Setd1bQ8CFT2 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Setd1bQ8CFT2 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Setd1bQ8CFT2 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Setd1bQ8CFT2 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Setd1bQ8CFT2 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Setd1bQ8CFT2 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Setd1bQ8CFT2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Setd1bQ8CFT2 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
Setd1bQ8CFT2 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Setd1bQ8CFT2 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Setd1bQ8CFT2 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Setd1bQ8CFT2 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Setd1bQ8CFT2 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Setd1bQ8CFT2 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Setd1bQ8CFT2 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Setd1bQ8CFT2 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Setd1bQ8CFT2 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Setd1bQ8CFT2 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
Setd1bQ8CFT2 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Setd1bQ8CFT2 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Setd1bQ8CFT2 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
Setd1bQ8CFT2 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Setd1bQ8CFT2 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Setd1bQ8CFT2 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Setd1bQ8CFT2 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Setd1bQ8CFT2 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Setd1bQ8CFT2 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Setd1bQ8CFT2 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Setd1bQ8CFT2 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Setd1bQ8CFT2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Setd1bQ8CFT2 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Setd1bQ8CFT2 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Setd1bQ8CFT2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Setd1bQ8CFT2 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Setd1bQ8CFT2 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Setd1bQ8CFT2 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
Setd1bQ8CFT2 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Setd1bQ8CFT2 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Setd1bQ8CFT2 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Setd1bQ8CFT2 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Setd1bQ8CFT2 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Setd1bQ8CFT2 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Setd1bQ8CFT2 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
Setd1bQ8CFT2 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Setd1bQ8CFT2 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Setd1bQ8CFT2 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Setd1bQ8CFT2 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Setd1bQ8CFT2 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Setd1bQ8CFT2 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Setd1bQ8CFT2 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Setd1bQ8CFT2 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Setd1bQ8CFT2 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Setd1bQ8CFT2 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Setd1bQ8CFT2 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
Setd1bQ8CFT2 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
Setd1bQ8CFT2 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Setd1bQ8CFT2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Setd1bQ8CFT2 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Setd1bQ8CFT2 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Setd1bQ8CFT2 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Setd1bQ8CFT2 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Setd1bQ8CFT2 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Setd1bQ8CFT2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Setd1bQ8CFT2 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Setd1bQ8CFT2 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Setd1bQ8CFT2 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Setd1bQ8CFT2 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Setd1bQ8CFT2 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Setd1bQ8CFT2 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
Setd1bQ8CFT2 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Setd1bQ8CFT2 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Setd1bQ8CFT2 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Setd1bQ8CFT2 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Setd1bQ8CFT2 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Setd1bQ8CFT2 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Setd1bQ8CFT2 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Setd1bQ8CFT2 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Setd1bQ8CFT2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Setd1bQ8CFT2 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Setd1bQ8CFT2 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
Setd1bQ8CFT2 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Setd1bQ8CFT2 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Setd1bQ8CFT2 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms