Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ercc8Q8CFD5 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ercc8Q8CFD5 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ercc8Q8CFD5 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ercc8Q8CFD5 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ercc8Q8CFD5 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ercc8Q8CFD5 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ercc8Q8CFD5 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ercc8Q8CFD5 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ercc8Q8CFD5 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ercc8Q8CFD5 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ercc8Q8CFD5 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ercc8Q8CFD5 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ercc8Q8CFD5 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ercc8Q8CFD5 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ercc8Q8CFD5 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ercc8Q8CFD5 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ercc8Q8CFD5 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ercc8Q8CFD5 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ercc8Q8CFD5 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ercc8Q8CFD5 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ercc8Q8CFD5 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ercc8Q8CFD5 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ercc8Q8CFD5 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ercc8Q8CFD5 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ercc8Q8CFD5 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ercc8Q8CFD5 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ercc8Q8CFD5 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ercc8Q8CFD5 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ercc8Q8CFD5 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ercc8Q8CFD5 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ercc8Q8CFD5 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ercc8Q8CFD5 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ercc8Q8CFD5 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ercc8Q8CFD5 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ercc8Q8CFD5 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ercc8Q8CFD5 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ercc8Q8CFD5 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ercc8Q8CFD5 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ercc8Q8CFD5 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ercc8Q8CFD5 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ercc8Q8CFD5 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ercc8Q8CFD5 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ercc8Q8CFD5 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ercc8Q8CFD5 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ercc8Q8CFD5 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ercc8Q8CFD5 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ercc8Q8CFD5 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ercc8Q8CFD5 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ercc8Q8CFD5 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ercc8Q8CFD5 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ercc8Q8CFD5 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ercc8Q8CFD5 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ercc8Q8CFD5 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ercc8Q8CFD5 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ercc8Q8CFD5 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ercc8Q8CFD5 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ercc8Q8CFD5 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ercc8Q8CFD5 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ercc8Q8CFD5 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ercc8Q8CFD5 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ercc8Q8CFD5 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ercc8Q8CFD5 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ercc8Q8CFD5 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ercc8Q8CFD5 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ercc8Q8CFD5 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ercc8Q8CFD5 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ercc8Q8CFD5 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ercc8Q8CFD5 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ercc8Q8CFD5 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ercc8Q8CFD5 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ercc8Q8CFD5 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ercc8Q8CFD5 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ercc8Q8CFD5 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ercc8Q8CFD5 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ercc8Q8CFD5 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ercc8Q8CFD5 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ercc8Q8CFD5 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ercc8Q8CFD5 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ercc8Q8CFD5 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ercc8Q8CFD5 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ercc8Q8CFD5 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ercc8Q8CFD5 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ercc8Q8CFD5 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ercc8Q8CFD5 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ercc8Q8CFD5 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ercc8Q8CFD5 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ercc8Q8CFD5 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ercc8Q8CFD5 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ercc8Q8CFD5 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ercc8Q8CFD5 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ercc8Q8CFD5 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ercc8Q8CFD5 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ercc8Q8CFD5 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ercc8Q8CFD5 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ercc8Q8CFD5 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ercc8Q8CFD5 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ercc8Q8CFD5 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ercc8Q8CFD5 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ercc8Q8CFD5 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms