Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFA7

Klf17, Krueppel-like factor 17, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf17Q8CFA7 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klf17Q8CFA7 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klf17Q8CFA7 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klf17Q8CFA7 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klf17Q8CFA7 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klf17Q8CFA7 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Klf17Q8CFA7 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klf17Q8CFA7 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klf17Q8CFA7 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Klf17Q8CFA7 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klf17Q8CFA7 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klf17Q8CFA7 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klf17Q8CFA7 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klf17Q8CFA7 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klf17Q8CFA7 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klf17Q8CFA7 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klf17Q8CFA7 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klf17Q8CFA7 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Klf17Q8CFA7 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klf17Q8CFA7 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klf17Q8CFA7 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Klf17Q8CFA7 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klf17Q8CFA7 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klf17Q8CFA7 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klf17Q8CFA7 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klf17Q8CFA7 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klf17Q8CFA7 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klf17Q8CFA7 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klf17Q8CFA7 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klf17Q8CFA7 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Klf17Q8CFA7 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Klf17Q8CFA7 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Klf17Q8CFA7 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Klf17Q8CFA7 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Klf17Q8CFA7 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Klf17Q8CFA7 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Klf17Q8CFA7 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Klf17Q8CFA7 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Klf17Q8CFA7 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Klf17Q8CFA7 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klf17Q8CFA7 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klf17Q8CFA7 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klf17Q8CFA7 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klf17Q8CFA7 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klf17Q8CFA7 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klf17Q8CFA7 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klf17Q8CFA7 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klf17Q8CFA7 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klf17Q8CFA7 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klf17Q8CFA7 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klf17Q8CFA7 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klf17Q8CFA7 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klf17Q8CFA7 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klf17Q8CFA7 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klf17Q8CFA7 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klf17Q8CFA7 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klf17Q8CFA7 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klf17Q8CFA7 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klf17Q8CFA7 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klf17Q8CFA7 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klf17Q8CFA7 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klf17Q8CFA7 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klf17Q8CFA7 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klf17Q8CFA7 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klf17Q8CFA7 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klf17Q8CFA7 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klf17Q8CFA7 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klf17Q8CFA7 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klf17Q8CFA7 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klf17Q8CFA7 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klf17Q8CFA7 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klf17Q8CFA7 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klf17Q8CFA7 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klf17Q8CFA7 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klf17Q8CFA7 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klf17Q8CFA7 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klf17Q8CFA7 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klf17Q8CFA7 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klf17Q8CFA7 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klf17Q8CFA7 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klf17Q8CFA7 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klf17Q8CFA7 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klf17Q8CFA7 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klf17Q8CFA7 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klf17Q8CFA7 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klf17Q8CFA7 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klf17Q8CFA7 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klf17Q8CFA7 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klf17Q8CFA7 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Klf17Q8CFA7 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klf17Q8CFA7 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klf17Q8CFA7 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klf17Q8CFA7 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klf17Q8CFA7 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klf17Q8CFA7 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Klf17Q8CFA7 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klf17Q8CFA7 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klf17Q8CFA7 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klf17Q8CFA7 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klf17Q8CFA7 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.2 ms