Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDG5

Crebrf, CREB3 regulatory factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrebrfQ8CDG5 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CrebrfQ8CDG5 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CrebrfQ8CDG5 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CrebrfQ8CDG5 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CrebrfQ8CDG5 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CrebrfQ8CDG5 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CrebrfQ8CDG5 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CrebrfQ8CDG5 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CrebrfQ8CDG5 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CrebrfQ8CDG5 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CrebrfQ8CDG5 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CrebrfQ8CDG5 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CrebrfQ8CDG5 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CrebrfQ8CDG5 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CrebrfQ8CDG5 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CrebrfQ8CDG5 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CrebrfQ8CDG5 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CrebrfQ8CDG5 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CrebrfQ8CDG5 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CrebrfQ8CDG5 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CrebrfQ8CDG5 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CrebrfQ8CDG5 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CrebrfQ8CDG5 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CrebrfQ8CDG5 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CrebrfQ8CDG5 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CrebrfQ8CDG5 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CrebrfQ8CDG5 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CrebrfQ8CDG5 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CrebrfQ8CDG5 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CrebrfQ8CDG5 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CrebrfQ8CDG5 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CrebrfQ8CDG5 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CrebrfQ8CDG5 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CrebrfQ8CDG5 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CrebrfQ8CDG5 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CrebrfQ8CDG5 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CrebrfQ8CDG5 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CrebrfQ8CDG5 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CrebrfQ8CDG5 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CrebrfQ8CDG5 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CrebrfQ8CDG5 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CrebrfQ8CDG5 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CrebrfQ8CDG5 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CrebrfQ8CDG5 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CrebrfQ8CDG5 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CrebrfQ8CDG5 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CrebrfQ8CDG5 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CrebrfQ8CDG5 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CrebrfQ8CDG5 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CrebrfQ8CDG5 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CrebrfQ8CDG5 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CrebrfQ8CDG5 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CrebrfQ8CDG5 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CrebrfQ8CDG5 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CrebrfQ8CDG5 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CrebrfQ8CDG5 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CrebrfQ8CDG5 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CrebrfQ8CDG5 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CrebrfQ8CDG5 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CrebrfQ8CDG5 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CrebrfQ8CDG5 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CrebrfQ8CDG5 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CrebrfQ8CDG5 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CrebrfQ8CDG5 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CrebrfQ8CDG5 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CrebrfQ8CDG5 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CrebrfQ8CDG5 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CrebrfQ8CDG5 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CrebrfQ8CDG5 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CrebrfQ8CDG5 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CrebrfQ8CDG5 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CrebrfQ8CDG5 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CrebrfQ8CDG5 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CrebrfQ8CDG5 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CrebrfQ8CDG5 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CrebrfQ8CDG5 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CrebrfQ8CDG5 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CrebrfQ8CDG5 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CrebrfQ8CDG5 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CrebrfQ8CDG5 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CrebrfQ8CDG5 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CrebrfQ8CDG5 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CrebrfQ8CDG5 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CrebrfQ8CDG5 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CrebrfQ8CDG5 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CrebrfQ8CDG5 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CrebrfQ8CDG5 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CrebrfQ8CDG5 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CrebrfQ8CDG5 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CrebrfQ8CDG5 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CrebrfQ8CDG5 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CrebrfQ8CDG5 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CrebrfQ8CDG5 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CrebrfQ8CDG5 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CrebrfQ8CDG5 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CrebrfQ8CDG5 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CrebrfQ8CDG5 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CrebrfQ8CDG5 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CrebrfQ8CDG5 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CrebrfQ8CDG5 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.1 ms