Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD33

6030452D12Rik, RIKEN cDNA 6030452D12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6030452D12RikQ8CD33 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
6030452D12RikQ8CD33 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
6030452D12RikQ8CD33 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
6030452D12RikQ8CD33 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
6030452D12RikQ8CD33 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
6030452D12RikQ8CD33 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
6030452D12RikQ8CD33 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
6030452D12RikQ8CD33 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
6030452D12RikQ8CD33 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
6030452D12RikQ8CD33 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
6030452D12RikQ8CD33 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
6030452D12RikQ8CD33 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
6030452D12RikQ8CD33 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
6030452D12RikQ8CD33 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
6030452D12RikQ8CD33 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
6030452D12RikQ8CD33 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
6030452D12RikQ8CD33 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
6030452D12RikQ8CD33 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
6030452D12RikQ8CD33 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
6030452D12RikQ8CD33 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
6030452D12RikQ8CD33 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
6030452D12RikQ8CD33 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
6030452D12RikQ8CD33 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
6030452D12RikQ8CD33 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
6030452D12RikQ8CD33 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
6030452D12RikQ8CD33 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
6030452D12RikQ8CD33 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
6030452D12RikQ8CD33 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
6030452D12RikQ8CD33 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
6030452D12RikQ8CD33 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
6030452D12RikQ8CD33 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
6030452D12RikQ8CD33 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
6030452D12RikQ8CD33 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
6030452D12RikQ8CD33 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
6030452D12RikQ8CD33 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
6030452D12RikQ8CD33 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
6030452D12RikQ8CD33 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
6030452D12RikQ8CD33 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
6030452D12RikQ8CD33 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
6030452D12RikQ8CD33 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
6030452D12RikQ8CD33 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
6030452D12RikQ8CD33 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
6030452D12RikQ8CD33 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
6030452D12RikQ8CD33 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
6030452D12RikQ8CD33 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
6030452D12RikQ8CD33 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
6030452D12RikQ8CD33 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
6030452D12RikQ8CD33 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
6030452D12RikQ8CD33 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
6030452D12RikQ8CD33 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
6030452D12RikQ8CD33 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
6030452D12RikQ8CD33 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
6030452D12RikQ8CD33 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
6030452D12RikQ8CD33 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
6030452D12RikQ8CD33 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
6030452D12RikQ8CD33 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
6030452D12RikQ8CD33 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
6030452D12RikQ8CD33 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
6030452D12RikQ8CD33 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
6030452D12RikQ8CD33 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
6030452D12RikQ8CD33 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
6030452D12RikQ8CD33 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
6030452D12RikQ8CD33 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
6030452D12RikQ8CD33 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
6030452D12RikQ8CD33 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
6030452D12RikQ8CD33 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
6030452D12RikQ8CD33 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
6030452D12RikQ8CD33 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
6030452D12RikQ8CD33 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
6030452D12RikQ8CD33 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
6030452D12RikQ8CD33 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
6030452D12RikQ8CD33 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
6030452D12RikQ8CD33 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
6030452D12RikQ8CD33 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
6030452D12RikQ8CD33 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
6030452D12RikQ8CD33 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
6030452D12RikQ8CD33 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
6030452D12RikQ8CD33 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
6030452D12RikQ8CD33 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
6030452D12RikQ8CD33 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
6030452D12RikQ8CD33 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
6030452D12RikQ8CD33 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
6030452D12RikQ8CD33 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
6030452D12RikQ8CD33 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
6030452D12RikQ8CD33 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
6030452D12RikQ8CD33 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
6030452D12RikQ8CD33 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
6030452D12RikQ8CD33 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
6030452D12RikQ8CD33 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
6030452D12RikQ8CD33 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
6030452D12RikQ8CD33 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
6030452D12RikQ8CD33 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
6030452D12RikQ8CD33 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
6030452D12RikQ8CD33 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
6030452D12RikQ8CD33 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
6030452D12RikQ8CD33 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
6030452D12RikQ8CD33 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
6030452D12RikQ8CD33 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
6030452D12RikQ8CD33 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
6030452D12RikQ8CD33 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms