Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCJ3

Ufl1, E3 UFM1-protein ligase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufl1Q8CCJ3 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ufl1Q8CCJ3 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ufl1Q8CCJ3 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Ufl1Q8CCJ3 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Ufl1Q8CCJ3 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Ufl1Q8CCJ3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ufl1Q8CCJ3 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ufl1Q8CCJ3 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ufl1Q8CCJ3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ufl1Q8CCJ3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ufl1Q8CCJ3 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ufl1Q8CCJ3 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ufl1Q8CCJ3 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ufl1Q8CCJ3 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ufl1Q8CCJ3 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ufl1Q8CCJ3 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ufl1Q8CCJ3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ufl1Q8CCJ3 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ufl1Q8CCJ3 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ufl1Q8CCJ3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ufl1Q8CCJ3 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ufl1Q8CCJ3 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ufl1Q8CCJ3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ufl1Q8CCJ3 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ufl1Q8CCJ3 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ufl1Q8CCJ3 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ufl1Q8CCJ3 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ufl1Q8CCJ3 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ufl1Q8CCJ3 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ufl1Q8CCJ3 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ufl1Q8CCJ3 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ufl1Q8CCJ3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ufl1Q8CCJ3 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ufl1Q8CCJ3 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ufl1Q8CCJ3 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ufl1Q8CCJ3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ufl1Q8CCJ3 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ufl1Q8CCJ3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ufl1Q8CCJ3 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ufl1Q8CCJ3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ufl1Q8CCJ3 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ufl1Q8CCJ3 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ufl1Q8CCJ3 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ufl1Q8CCJ3 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ufl1Q8CCJ3 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ufl1Q8CCJ3 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ufl1Q8CCJ3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ufl1Q8CCJ3 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ufl1Q8CCJ3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ufl1Q8CCJ3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ufl1Q8CCJ3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ufl1Q8CCJ3 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ufl1Q8CCJ3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ufl1Q8CCJ3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ufl1Q8CCJ3 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ufl1Q8CCJ3 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ufl1Q8CCJ3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ufl1Q8CCJ3 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ufl1Q8CCJ3 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ufl1Q8CCJ3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ufl1Q8CCJ3 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ufl1Q8CCJ3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ufl1Q8CCJ3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ufl1Q8CCJ3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ufl1Q8CCJ3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ufl1Q8CCJ3 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ufl1Q8CCJ3 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ufl1Q8CCJ3 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ufl1Q8CCJ3 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ufl1Q8CCJ3 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ufl1Q8CCJ3 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ufl1Q8CCJ3 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ufl1Q8CCJ3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ufl1Q8CCJ3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ufl1Q8CCJ3 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ufl1Q8CCJ3 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ufl1Q8CCJ3 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ufl1Q8CCJ3 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ufl1Q8CCJ3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ufl1Q8CCJ3 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ufl1Q8CCJ3 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ufl1Q8CCJ3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ufl1Q8CCJ3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ufl1Q8CCJ3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ufl1Q8CCJ3 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Ufl1Q8CCJ3 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ufl1Q8CCJ3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ufl1Q8CCJ3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ufl1Q8CCJ3 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ufl1Q8CCJ3 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ufl1Q8CCJ3 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ufl1Q8CCJ3 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ufl1Q8CCJ3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ufl1Q8CCJ3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ufl1Q8CCJ3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ufl1Q8CCJ3 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ufl1Q8CCJ3 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ufl1Q8CCJ3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ufl1Q8CCJ3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ufl1Q8CCJ3 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms