Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6A8

Bhlhe22, Class E basic helix-loop-helix protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe22Q8C6A8 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bhlhe22Q8C6A8 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bhlhe22Q8C6A8 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bhlhe22Q8C6A8 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bhlhe22Q8C6A8 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bhlhe22Q8C6A8 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bhlhe22Q8C6A8 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bhlhe22Q8C6A8 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bhlhe22Q8C6A8 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bhlhe22Q8C6A8 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Bhlhe22Q8C6A8 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bhlhe22Q8C6A8 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bhlhe22Q8C6A8 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bhlhe22Q8C6A8 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bhlhe22Q8C6A8 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bhlhe22Q8C6A8 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bhlhe22Q8C6A8 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bhlhe22Q8C6A8 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bhlhe22Q8C6A8 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bhlhe22Q8C6A8 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bhlhe22Q8C6A8 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Bhlhe22Q8C6A8 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bhlhe22Q8C6A8 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bhlhe22Q8C6A8 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bhlhe22Q8C6A8 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bhlhe22Q8C6A8 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bhlhe22Q8C6A8 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Bhlhe22Q8C6A8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bhlhe22Q8C6A8 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bhlhe22Q8C6A8 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bhlhe22Q8C6A8 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bhlhe22Q8C6A8 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bhlhe22Q8C6A8 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bhlhe22Q8C6A8 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bhlhe22Q8C6A8 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bhlhe22Q8C6A8 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bhlhe22Q8C6A8 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bhlhe22Q8C6A8 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Bhlhe22Q8C6A8 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Bhlhe22Q8C6A8 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bhlhe22Q8C6A8 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Bhlhe22Q8C6A8 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bhlhe22Q8C6A8 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bhlhe22Q8C6A8 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Bhlhe22Q8C6A8 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bhlhe22Q8C6A8 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bhlhe22Q8C6A8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bhlhe22Q8C6A8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bhlhe22Q8C6A8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Bhlhe22Q8C6A8 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bhlhe22Q8C6A8 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Bhlhe22Q8C6A8 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Bhlhe22Q8C6A8 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Bhlhe22Q8C6A8 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bhlhe22Q8C6A8 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Bhlhe22Q8C6A8 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bhlhe22Q8C6A8 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bhlhe22Q8C6A8 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bhlhe22Q8C6A8 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bhlhe22Q8C6A8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bhlhe22Q8C6A8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bhlhe22Q8C6A8 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bhlhe22Q8C6A8 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bhlhe22Q8C6A8 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bhlhe22Q8C6A8 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bhlhe22Q8C6A8 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bhlhe22Q8C6A8 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bhlhe22Q8C6A8 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bhlhe22Q8C6A8 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bhlhe22Q8C6A8 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Bhlhe22Q8C6A8 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Bhlhe22Q8C6A8 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bhlhe22Q8C6A8 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bhlhe22Q8C6A8 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bhlhe22Q8C6A8 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bhlhe22Q8C6A8 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bhlhe22Q8C6A8 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bhlhe22Q8C6A8 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bhlhe22Q8C6A8 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bhlhe22Q8C6A8 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bhlhe22Q8C6A8 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bhlhe22Q8C6A8 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bhlhe22Q8C6A8 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Bhlhe22Q8C6A8 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bhlhe22Q8C6A8 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bhlhe22Q8C6A8 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bhlhe22Q8C6A8 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bhlhe22Q8C6A8 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bhlhe22Q8C6A8 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bhlhe22Q8C6A8 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bhlhe22Q8C6A8 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bhlhe22Q8C6A8 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bhlhe22Q8C6A8 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bhlhe22Q8C6A8 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bhlhe22Q8C6A8 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bhlhe22Q8C6A8 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bhlhe22Q8C6A8 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bhlhe22Q8C6A8 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bhlhe22Q8C6A8 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bhlhe22Q8C6A8 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms