Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
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Ccdc113Q8C5T8 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc113Q8C5T8 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc113Q8C5T8 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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Ccdc113Q8C5T8 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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Ccdc113Q8C5T8 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc113Q8C5T8 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc113Q8C5T8 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc113Q8C5T8 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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Ccdc113Q8C5T8 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc113Q8C5T8 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc113Q8C5T8 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
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Ccdc113Q8C5T8 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc113Q8C5T8 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc113Q8C5T8 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc113Q8C5T8 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc113Q8C5T8 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
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