Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3X2

Ccdc90b, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc90bQ8C3X2 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc90bQ8C3X2 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc90bQ8C3X2 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc90bQ8C3X2 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc90bQ8C3X2 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc90bQ8C3X2 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc90bQ8C3X2 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc90bQ8C3X2 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc90bQ8C3X2 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc90bQ8C3X2 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc90bQ8C3X2 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc90bQ8C3X2 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc90bQ8C3X2 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc90bQ8C3X2 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc90bQ8C3X2 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc90bQ8C3X2 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc90bQ8C3X2 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc90bQ8C3X2 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc90bQ8C3X2 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc90bQ8C3X2 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc90bQ8C3X2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc90bQ8C3X2 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc90bQ8C3X2 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc90bQ8C3X2 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc90bQ8C3X2 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc90bQ8C3X2 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc90bQ8C3X2 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc90bQ8C3X2 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc90bQ8C3X2 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc90bQ8C3X2 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc90bQ8C3X2 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc90bQ8C3X2 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc90bQ8C3X2 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc90bQ8C3X2 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc90bQ8C3X2 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc90bQ8C3X2 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc90bQ8C3X2 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc90bQ8C3X2 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc90bQ8C3X2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc90bQ8C3X2 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc90bQ8C3X2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc90bQ8C3X2 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc90bQ8C3X2 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc90bQ8C3X2 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc90bQ8C3X2 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc90bQ8C3X2 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc90bQ8C3X2 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc90bQ8C3X2 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc90bQ8C3X2 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc90bQ8C3X2 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc90bQ8C3X2 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc90bQ8C3X2 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc90bQ8C3X2 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc90bQ8C3X2 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc90bQ8C3X2 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc90bQ8C3X2 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc90bQ8C3X2 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc90bQ8C3X2 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc90bQ8C3X2 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc90bQ8C3X2 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc90bQ8C3X2 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc90bQ8C3X2 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc90bQ8C3X2 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc90bQ8C3X2 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc90bQ8C3X2 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc90bQ8C3X2 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc90bQ8C3X2 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc90bQ8C3X2 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc90bQ8C3X2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc90bQ8C3X2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc90bQ8C3X2 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc90bQ8C3X2 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc90bQ8C3X2 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc90bQ8C3X2 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc90bQ8C3X2 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc90bQ8C3X2 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc90bQ8C3X2 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc90bQ8C3X2 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc90bQ8C3X2 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc90bQ8C3X2 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc90bQ8C3X2 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc90bQ8C3X2 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc90bQ8C3X2 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc90bQ8C3X2 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc90bQ8C3X2 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc90bQ8C3X2 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc90bQ8C3X2 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc90bQ8C3X2 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc90bQ8C3X2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc90bQ8C3X2 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc90bQ8C3X2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc90bQ8C3X2 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc90bQ8C3X2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc90bQ8C3X2 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc90bQ8C3X2 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc90bQ8C3X2 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc90bQ8C3X2 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc90bQ8C3X2 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc90bQ8C3X2 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc90bQ8C3X2 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms