Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1M2

Znf428, Zinc finger protein 428, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf428Q8C1M2 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Znf428Q8C1M2 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Znf428Q8C1M2 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Znf428Q8C1M2 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Znf428Q8C1M2 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Znf428Q8C1M2 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Znf428Q8C1M2 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Znf428Q8C1M2 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Znf428Q8C1M2 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Znf428Q8C1M2 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Znf428Q8C1M2 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Znf428Q8C1M2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Znf428Q8C1M2 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Znf428Q8C1M2 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Znf428Q8C1M2 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Znf428Q8C1M2 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Znf428Q8C1M2 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Znf428Q8C1M2 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Znf428Q8C1M2 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Znf428Q8C1M2 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Znf428Q8C1M2 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Znf428Q8C1M2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Znf428Q8C1M2 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Znf428Q8C1M2 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Znf428Q8C1M2 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Znf428Q8C1M2 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Znf428Q8C1M2 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Znf428Q8C1M2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Znf428Q8C1M2 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Znf428Q8C1M2 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Znf428Q8C1M2 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Znf428Q8C1M2 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Znf428Q8C1M2 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Znf428Q8C1M2 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Znf428Q8C1M2 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Znf428Q8C1M2 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Znf428Q8C1M2 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Znf428Q8C1M2 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Znf428Q8C1M2 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Znf428Q8C1M2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Znf428Q8C1M2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Znf428Q8C1M2 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Znf428Q8C1M2 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Znf428Q8C1M2 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Znf428Q8C1M2 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Znf428Q8C1M2 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Znf428Q8C1M2 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Znf428Q8C1M2 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Znf428Q8C1M2 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Znf428Q8C1M2 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Znf428Q8C1M2 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Znf428Q8C1M2 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Znf428Q8C1M2 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Znf428Q8C1M2 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Znf428Q8C1M2 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Znf428Q8C1M2 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Znf428Q8C1M2 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Znf428Q8C1M2 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Znf428Q8C1M2 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Znf428Q8C1M2 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Znf428Q8C1M2 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Znf428Q8C1M2 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Znf428Q8C1M2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Znf428Q8C1M2 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Znf428Q8C1M2 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Znf428Q8C1M2 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Znf428Q8C1M2 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Znf428Q8C1M2 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Znf428Q8C1M2 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Znf428Q8C1M2 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Znf428Q8C1M2 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Znf428Q8C1M2 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Znf428Q8C1M2 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Znf428Q8C1M2 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Znf428Q8C1M2 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Znf428Q8C1M2 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Znf428Q8C1M2 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Znf428Q8C1M2 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Znf428Q8C1M2 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Znf428Q8C1M2 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Znf428Q8C1M2 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Znf428Q8C1M2 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Znf428Q8C1M2 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Znf428Q8C1M2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Znf428Q8C1M2 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Znf428Q8C1M2 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Znf428Q8C1M2 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Znf428Q8C1M2 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Znf428Q8C1M2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Znf428Q8C1M2 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Znf428Q8C1M2 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Znf428Q8C1M2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Znf428Q8C1M2 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Znf428Q8C1M2 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Znf428Q8C1M2 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Znf428Q8C1M2 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Znf428Q8C1M2 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Znf428Q8C1M2 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Znf428Q8C1M2 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Znf428Q8C1M2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms