Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX32

Slx1b, Structure-specific endonuclease subunit SLX1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx1bQ8BX32 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Slx1bQ8BX32 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Slx1bQ8BX32 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Slx1bQ8BX32 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Slx1bQ8BX32 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Slx1bQ8BX32 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Slx1bQ8BX32 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Slx1bQ8BX32 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Slx1bQ8BX32 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Slx1bQ8BX32 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Slx1bQ8BX32 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Slx1bQ8BX32 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Slx1bQ8BX32 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Slx1bQ8BX32 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Slx1bQ8BX32 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Slx1bQ8BX32 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Slx1bQ8BX32 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Slx1bQ8BX32 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Slx1bQ8BX32 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Slx1bQ8BX32 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Slx1bQ8BX32 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Slx1bQ8BX32 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Slx1bQ8BX32 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Slx1bQ8BX32 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Slx1bQ8BX32 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Slx1bQ8BX32 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Slx1bQ8BX32 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Slx1bQ8BX32 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Slx1bQ8BX32 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Slx1bQ8BX32 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Slx1bQ8BX32 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Slx1bQ8BX32 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Slx1bQ8BX32 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Slx1bQ8BX32 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Slx1bQ8BX32 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Slx1bQ8BX32 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Slx1bQ8BX32 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Slx1bQ8BX32 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Slx1bQ8BX32 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Slx1bQ8BX32 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Slx1bQ8BX32 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Slx1bQ8BX32 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Slx1bQ8BX32 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Slx1bQ8BX32 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Slx1bQ8BX32 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Slx1bQ8BX32 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Slx1bQ8BX32 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Slx1bQ8BX32 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Slx1bQ8BX32 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Slx1bQ8BX32 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Slx1bQ8BX32 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Slx1bQ8BX32 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Slx1bQ8BX32 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Slx1bQ8BX32 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Slx1bQ8BX32 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Slx1bQ8BX32 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Slx1bQ8BX32 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Slx1bQ8BX32 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Slx1bQ8BX32 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Slx1bQ8BX32 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Slx1bQ8BX32 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Slx1bQ8BX32 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Slx1bQ8BX32 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Slx1bQ8BX32 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Slx1bQ8BX32 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Slx1bQ8BX32 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Slx1bQ8BX32 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Slx1bQ8BX32 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Slx1bQ8BX32 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Slx1bQ8BX32 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Slx1bQ8BX32 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Slx1bQ8BX32 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Slx1bQ8BX32 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Slx1bQ8BX32 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Slx1bQ8BX32 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Slx1bQ8BX32 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Slx1bQ8BX32 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Slx1bQ8BX32 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Slx1bQ8BX32 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Slx1bQ8BX32 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Slx1bQ8BX32 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Slx1bQ8BX32 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Slx1bQ8BX32 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Slx1bQ8BX32 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Slx1bQ8BX32 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Slx1bQ8BX32 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Slx1bQ8BX32 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Slx1bQ8BX32 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Slx1bQ8BX32 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Slx1bQ8BX32 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Slx1bQ8BX32 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Slx1bQ8BX32 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Slx1bQ8BX32 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Slx1bQ8BX32 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Slx1bQ8BX32 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Slx1bQ8BX32 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Slx1bQ8BX32 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Slx1bQ8BX32 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Slx1bQ8BX32 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Slx1bQ8BX32 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 753.6 ms