Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctdsp2Q8BX07 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctdsp2Q8BX07 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctdsp2Q8BX07 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctdsp2Q8BX07 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctdsp2Q8BX07 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctdsp2Q8BX07 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctdsp2Q8BX07 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctdsp2Q8BX07 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctdsp2Q8BX07 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctdsp2Q8BX07 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctdsp2Q8BX07 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctdsp2Q8BX07 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctdsp2Q8BX07 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctdsp2Q8BX07 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctdsp2Q8BX07 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctdsp2Q8BX07 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctdsp2Q8BX07 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctdsp2Q8BX07 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctdsp2Q8BX07 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctdsp2Q8BX07 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctdsp2Q8BX07 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctdsp2Q8BX07 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctdsp2Q8BX07 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctdsp2Q8BX07 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctdsp2Q8BX07 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctdsp2Q8BX07 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctdsp2Q8BX07 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctdsp2Q8BX07 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctdsp2Q8BX07 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctdsp2Q8BX07 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctdsp2Q8BX07 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctdsp2Q8BX07 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctdsp2Q8BX07 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctdsp2Q8BX07 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctdsp2Q8BX07 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctdsp2Q8BX07 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ctdsp2Q8BX07 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ctdsp2Q8BX07 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ctdsp2Q8BX07 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ctdsp2Q8BX07 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Ctdsp2Q8BX07 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ctdsp2Q8BX07 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ctdsp2Q8BX07 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ctdsp2Q8BX07 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ctdsp2Q8BX07 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ctdsp2Q8BX07 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ctdsp2Q8BX07 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ctdsp2Q8BX07 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ctdsp2Q8BX07 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ctdsp2Q8BX07 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctdsp2Q8BX07 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctdsp2Q8BX07 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctdsp2Q8BX07 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctdsp2Q8BX07 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctdsp2Q8BX07 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctdsp2Q8BX07 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctdsp2Q8BX07 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctdsp2Q8BX07 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctdsp2Q8BX07 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctdsp2Q8BX07 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctdsp2Q8BX07 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctdsp2Q8BX07 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctdsp2Q8BX07 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctdsp2Q8BX07 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctdsp2Q8BX07 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctdsp2Q8BX07 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctdsp2Q8BX07 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctdsp2Q8BX07 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctdsp2Q8BX07 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctdsp2Q8BX07 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctdsp2Q8BX07 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctdsp2Q8BX07 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctdsp2Q8BX07 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctdsp2Q8BX07 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctdsp2Q8BX07 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctdsp2Q8BX07 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctdsp2Q8BX07 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctdsp2Q8BX07 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctdsp2Q8BX07 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctdsp2Q8BX07 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctdsp2Q8BX07 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctdsp2Q8BX07 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctdsp2Q8BX07 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctdsp2Q8BX07 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctdsp2Q8BX07 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctdsp2Q8BX07 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctdsp2Q8BX07 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ctdsp2Q8BX07 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ctdsp2Q8BX07 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ctdsp2Q8BX07 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ctdsp2Q8BX07 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ctdsp2Q8BX07 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ctdsp2Q8BX07 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ctdsp2Q8BX07 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ctdsp2Q8BX07 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ctdsp2Q8BX07 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ctdsp2Q8BX07 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ctdsp2Q8BX07 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ctdsp2Q8BX07 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
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