Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTY8

Scfd2, Sec1 family domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scfd2Q8BTY8 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scfd2Q8BTY8 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scfd2Q8BTY8 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scfd2Q8BTY8 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scfd2Q8BTY8 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scfd2Q8BTY8 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scfd2Q8BTY8 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scfd2Q8BTY8 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scfd2Q8BTY8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scfd2Q8BTY8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scfd2Q8BTY8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scfd2Q8BTY8 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scfd2Q8BTY8 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scfd2Q8BTY8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scfd2Q8BTY8 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scfd2Q8BTY8 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scfd2Q8BTY8 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scfd2Q8BTY8 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Scfd2Q8BTY8 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scfd2Q8BTY8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scfd2Q8BTY8 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Scfd2Q8BTY8 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scfd2Q8BTY8 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scfd2Q8BTY8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scfd2Q8BTY8 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scfd2Q8BTY8 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scfd2Q8BTY8 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scfd2Q8BTY8 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scfd2Q8BTY8 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scfd2Q8BTY8 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scfd2Q8BTY8 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scfd2Q8BTY8 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scfd2Q8BTY8 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Scfd2Q8BTY8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scfd2Q8BTY8 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scfd2Q8BTY8 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scfd2Q8BTY8 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Scfd2Q8BTY8 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scfd2Q8BTY8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scfd2Q8BTY8 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scfd2Q8BTY8 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scfd2Q8BTY8 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scfd2Q8BTY8 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scfd2Q8BTY8 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scfd2Q8BTY8 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scfd2Q8BTY8 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Scfd2Q8BTY8 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scfd2Q8BTY8 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scfd2Q8BTY8 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scfd2Q8BTY8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scfd2Q8BTY8 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Scfd2Q8BTY8 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Scfd2Q8BTY8 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Scfd2Q8BTY8 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Scfd2Q8BTY8 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Scfd2Q8BTY8 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Scfd2Q8BTY8 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Scfd2Q8BTY8 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scfd2Q8BTY8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scfd2Q8BTY8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scfd2Q8BTY8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scfd2Q8BTY8 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scfd2Q8BTY8 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scfd2Q8BTY8 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scfd2Q8BTY8 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scfd2Q8BTY8 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Scfd2Q8BTY8 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Scfd2Q8BTY8 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Scfd2Q8BTY8 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Scfd2Q8BTY8 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Scfd2Q8BTY8 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Scfd2Q8BTY8 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Scfd2Q8BTY8 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Scfd2Q8BTY8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Scfd2Q8BTY8 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Scfd2Q8BTY8 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Scfd2Q8BTY8 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Scfd2Q8BTY8 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Scfd2Q8BTY8 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Scfd2Q8BTY8 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Scfd2Q8BTY8 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Scfd2Q8BTY8 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Scfd2Q8BTY8 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Scfd2Q8BTY8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Scfd2Q8BTY8 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Scfd2Q8BTY8 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Scfd2Q8BTY8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Scfd2Q8BTY8 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scfd2Q8BTY8 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scfd2Q8BTY8 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scfd2Q8BTY8 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scfd2Q8BTY8 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scfd2Q8BTY8 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scfd2Q8BTY8 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Scfd2Q8BTY8 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Scfd2Q8BTY8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Scfd2Q8BTY8 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Scfd2Q8BTY8 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Scfd2Q8BTY8 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Scfd2Q8BTY8 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms