Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTQ0

PcgF3, Polycomb group RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcgF3Q8BTQ0 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PcgF3Q8BTQ0 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PcgF3Q8BTQ0 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PcgF3Q8BTQ0 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PcgF3Q8BTQ0 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PcgF3Q8BTQ0 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PcgF3Q8BTQ0 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PcgF3Q8BTQ0 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PcgF3Q8BTQ0 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PcgF3Q8BTQ0 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PcgF3Q8BTQ0 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PcgF3Q8BTQ0 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PcgF3Q8BTQ0 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PcgF3Q8BTQ0 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PcgF3Q8BTQ0 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PcgF3Q8BTQ0 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PcgF3Q8BTQ0 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PcgF3Q8BTQ0 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PcgF3Q8BTQ0 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PcgF3Q8BTQ0 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PcgF3Q8BTQ0 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PcgF3Q8BTQ0 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PcgF3Q8BTQ0 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PcgF3Q8BTQ0 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PcgF3Q8BTQ0 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PcgF3Q8BTQ0 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PcgF3Q8BTQ0 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PcgF3Q8BTQ0 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PcgF3Q8BTQ0 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PcgF3Q8BTQ0 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PcgF3Q8BTQ0 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PcgF3Q8BTQ0 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PcgF3Q8BTQ0 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PcgF3Q8BTQ0 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PcgF3Q8BTQ0 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PcgF3Q8BTQ0 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PcgF3Q8BTQ0 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PcgF3Q8BTQ0 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PcgF3Q8BTQ0 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PcgF3Q8BTQ0 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PcgF3Q8BTQ0 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PcgF3Q8BTQ0 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PcgF3Q8BTQ0 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PcgF3Q8BTQ0 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PcgF3Q8BTQ0 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PcgF3Q8BTQ0 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PcgF3Q8BTQ0 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PcgF3Q8BTQ0 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PcgF3Q8BTQ0 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PcgF3Q8BTQ0 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PcgF3Q8BTQ0 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PcgF3Q8BTQ0 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PcgF3Q8BTQ0 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PcgF3Q8BTQ0 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PcgF3Q8BTQ0 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PcgF3Q8BTQ0 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PcgF3Q8BTQ0 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PcgF3Q8BTQ0 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PcgF3Q8BTQ0 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PcgF3Q8BTQ0 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PcgF3Q8BTQ0 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PcgF3Q8BTQ0 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PcgF3Q8BTQ0 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PcgF3Q8BTQ0 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PcgF3Q8BTQ0 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PcgF3Q8BTQ0 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PcgF3Q8BTQ0 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PcgF3Q8BTQ0 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PcgF3Q8BTQ0 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PcgF3Q8BTQ0 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PcgF3Q8BTQ0 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PcgF3Q8BTQ0 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PcgF3Q8BTQ0 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PcgF3Q8BTQ0 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PcgF3Q8BTQ0 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PcgF3Q8BTQ0 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PcgF3Q8BTQ0 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PcgF3Q8BTQ0 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PcgF3Q8BTQ0 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PcgF3Q8BTQ0 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PcgF3Q8BTQ0 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PcgF3Q8BTQ0 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PcgF3Q8BTQ0 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PcgF3Q8BTQ0 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PcgF3Q8BTQ0 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PcgF3Q8BTQ0 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PcgF3Q8BTQ0 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PcgF3Q8BTQ0 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PcgF3Q8BTQ0 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PcgF3Q8BTQ0 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PcgF3Q8BTQ0 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PcgF3Q8BTQ0 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PcgF3Q8BTQ0 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PcgF3Q8BTQ0 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PcgF3Q8BTQ0 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PcgF3Q8BTQ0 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PcgF3Q8BTQ0 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PcgF3Q8BTQ0 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PcgF3Q8BTQ0 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PcgF3Q8BTQ0 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms