Protein–RNA interactions for Protein: Q8BT07

Cep55, Centrosomal protein of 55 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep55Q8BT07 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cep55Q8BT07 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cep55Q8BT07 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cep55Q8BT07 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cep55Q8BT07 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cep55Q8BT07 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cep55Q8BT07 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cep55Q8BT07 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cep55Q8BT07 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cep55Q8BT07 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Cep55Q8BT07 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cep55Q8BT07 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cep55Q8BT07 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cep55Q8BT07 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cep55Q8BT07 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cep55Q8BT07 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cep55Q8BT07 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cep55Q8BT07 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cep55Q8BT07 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cep55Q8BT07 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cep55Q8BT07 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cep55Q8BT07 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cep55Q8BT07 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cep55Q8BT07 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cep55Q8BT07 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cep55Q8BT07 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cep55Q8BT07 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cep55Q8BT07 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cep55Q8BT07 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cep55Q8BT07 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cep55Q8BT07 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cep55Q8BT07 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cep55Q8BT07 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cep55Q8BT07 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cep55Q8BT07 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cep55Q8BT07 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cep55Q8BT07 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cep55Q8BT07 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cep55Q8BT07 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cep55Q8BT07 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cep55Q8BT07 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cep55Q8BT07 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cep55Q8BT07 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cep55Q8BT07 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cep55Q8BT07 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cep55Q8BT07 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cep55Q8BT07 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cep55Q8BT07 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cep55Q8BT07 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cep55Q8BT07 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cep55Q8BT07 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cep55Q8BT07 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cep55Q8BT07 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cep55Q8BT07 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cep55Q8BT07 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cep55Q8BT07 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cep55Q8BT07 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cep55Q8BT07 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cep55Q8BT07 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cep55Q8BT07 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Cep55Q8BT07 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cep55Q8BT07 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cep55Q8BT07 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cep55Q8BT07 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cep55Q8BT07 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cep55Q8BT07 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cep55Q8BT07 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cep55Q8BT07 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cep55Q8BT07 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cep55Q8BT07 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cep55Q8BT07 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cep55Q8BT07 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cep55Q8BT07 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cep55Q8BT07 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cep55Q8BT07 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cep55Q8BT07 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cep55Q8BT07 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Cep55Q8BT07 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cep55Q8BT07 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cep55Q8BT07 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cep55Q8BT07 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cep55Q8BT07 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cep55Q8BT07 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cep55Q8BT07 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cep55Q8BT07 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cep55Q8BT07 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cep55Q8BT07 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cep55Q8BT07 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cep55Q8BT07 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cep55Q8BT07 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cep55Q8BT07 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cep55Q8BT07 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cep55Q8BT07 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cep55Q8BT07 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cep55Q8BT07 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cep55Q8BT07 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cep55Q8BT07 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cep55Q8BT07 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cep55Q8BT07 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cep55Q8BT07 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms