Protein–RNA interactions for Protein: Q8BQN9

C030005K15Rik, RIKEN cDNA C030005K15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C030005K15RikQ8BQN9 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C030005K15RikQ8BQN9 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C030005K15RikQ8BQN9 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C030005K15RikQ8BQN9 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C030005K15RikQ8BQN9 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C030005K15RikQ8BQN9 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C030005K15RikQ8BQN9 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C030005K15RikQ8BQN9 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C030005K15RikQ8BQN9 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C030005K15RikQ8BQN9 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C030005K15RikQ8BQN9 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C030005K15RikQ8BQN9 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C030005K15RikQ8BQN9 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C030005K15RikQ8BQN9 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C030005K15RikQ8BQN9 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C030005K15RikQ8BQN9 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C030005K15RikQ8BQN9 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C030005K15RikQ8BQN9 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C030005K15RikQ8BQN9 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C030005K15RikQ8BQN9 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
C030005K15RikQ8BQN9 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C030005K15RikQ8BQN9 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C030005K15RikQ8BQN9 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C030005K15RikQ8BQN9 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C030005K15RikQ8BQN9 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C030005K15RikQ8BQN9 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C030005K15RikQ8BQN9 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C030005K15RikQ8BQN9 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C030005K15RikQ8BQN9 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C030005K15RikQ8BQN9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
C030005K15RikQ8BQN9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C030005K15RikQ8BQN9 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C030005K15RikQ8BQN9 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C030005K15RikQ8BQN9 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C030005K15RikQ8BQN9 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C030005K15RikQ8BQN9 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C030005K15RikQ8BQN9 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C030005K15RikQ8BQN9 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C030005K15RikQ8BQN9 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C030005K15RikQ8BQN9 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C030005K15RikQ8BQN9 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C030005K15RikQ8BQN9 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C030005K15RikQ8BQN9 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C030005K15RikQ8BQN9 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C030005K15RikQ8BQN9 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
C030005K15RikQ8BQN9 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C030005K15RikQ8BQN9 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C030005K15RikQ8BQN9 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C030005K15RikQ8BQN9 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C030005K15RikQ8BQN9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C030005K15RikQ8BQN9 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C030005K15RikQ8BQN9 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C030005K15RikQ8BQN9 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C030005K15RikQ8BQN9 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C030005K15RikQ8BQN9 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C030005K15RikQ8BQN9 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C030005K15RikQ8BQN9 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C030005K15RikQ8BQN9 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C030005K15RikQ8BQN9 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C030005K15RikQ8BQN9 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C030005K15RikQ8BQN9 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
C030005K15RikQ8BQN9 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C030005K15RikQ8BQN9 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C030005K15RikQ8BQN9 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C030005K15RikQ8BQN9 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C030005K15RikQ8BQN9 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C030005K15RikQ8BQN9 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C030005K15RikQ8BQN9 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C030005K15RikQ8BQN9 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C030005K15RikQ8BQN9 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C030005K15RikQ8BQN9 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C030005K15RikQ8BQN9 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C030005K15RikQ8BQN9 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C030005K15RikQ8BQN9 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C030005K15RikQ8BQN9 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C030005K15RikQ8BQN9 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C030005K15RikQ8BQN9 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C030005K15RikQ8BQN9 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C030005K15RikQ8BQN9 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C030005K15RikQ8BQN9 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C030005K15RikQ8BQN9 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
C030005K15RikQ8BQN9 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C030005K15RikQ8BQN9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C030005K15RikQ8BQN9 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C030005K15RikQ8BQN9 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C030005K15RikQ8BQN9 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C030005K15RikQ8BQN9 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C030005K15RikQ8BQN9 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
C030005K15RikQ8BQN9 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C030005K15RikQ8BQN9 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C030005K15RikQ8BQN9 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C030005K15RikQ8BQN9 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C030005K15RikQ8BQN9 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C030005K15RikQ8BQN9 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C030005K15RikQ8BQN9 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C030005K15RikQ8BQN9 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C030005K15RikQ8BQN9 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C030005K15RikQ8BQN9 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C030005K15RikQ8BQN9 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C030005K15RikQ8BQN9 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms