Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMJ8

Sp8, Transcription factor Sp8, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp8Q8BMJ8 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sp8Q8BMJ8 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sp8Q8BMJ8 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sp8Q8BMJ8 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sp8Q8BMJ8 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sp8Q8BMJ8 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sp8Q8BMJ8 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sp8Q8BMJ8 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sp8Q8BMJ8 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sp8Q8BMJ8 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sp8Q8BMJ8 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sp8Q8BMJ8 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sp8Q8BMJ8 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sp8Q8BMJ8 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sp8Q8BMJ8 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sp8Q8BMJ8 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sp8Q8BMJ8 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sp8Q8BMJ8 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sp8Q8BMJ8 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sp8Q8BMJ8 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Sp8Q8BMJ8 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sp8Q8BMJ8 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sp8Q8BMJ8 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sp8Q8BMJ8 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sp8Q8BMJ8 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sp8Q8BMJ8 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sp8Q8BMJ8 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sp8Q8BMJ8 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sp8Q8BMJ8 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sp8Q8BMJ8 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sp8Q8BMJ8 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sp8Q8BMJ8 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sp8Q8BMJ8 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sp8Q8BMJ8 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sp8Q8BMJ8 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Sp8Q8BMJ8 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sp8Q8BMJ8 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sp8Q8BMJ8 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sp8Q8BMJ8 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Sp8Q8BMJ8 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sp8Q8BMJ8 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Sp8Q8BMJ8 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sp8Q8BMJ8 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sp8Q8BMJ8 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sp8Q8BMJ8 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sp8Q8BMJ8 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sp8Q8BMJ8 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sp8Q8BMJ8 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sp8Q8BMJ8 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sp8Q8BMJ8 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sp8Q8BMJ8 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sp8Q8BMJ8 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sp8Q8BMJ8 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sp8Q8BMJ8 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sp8Q8BMJ8 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sp8Q8BMJ8 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sp8Q8BMJ8 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sp8Q8BMJ8 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Sp8Q8BMJ8 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sp8Q8BMJ8 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sp8Q8BMJ8 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sp8Q8BMJ8 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sp8Q8BMJ8 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sp8Q8BMJ8 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sp8Q8BMJ8 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sp8Q8BMJ8 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sp8Q8BMJ8 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sp8Q8BMJ8 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sp8Q8BMJ8 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sp8Q8BMJ8 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sp8Q8BMJ8 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sp8Q8BMJ8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sp8Q8BMJ8 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sp8Q8BMJ8 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Sp8Q8BMJ8 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sp8Q8BMJ8 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sp8Q8BMJ8 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sp8Q8BMJ8 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sp8Q8BMJ8 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sp8Q8BMJ8 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sp8Q8BMJ8 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sp8Q8BMJ8 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sp8Q8BMJ8 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sp8Q8BMJ8 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sp8Q8BMJ8 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sp8Q8BMJ8 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sp8Q8BMJ8 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sp8Q8BMJ8 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sp8Q8BMJ8 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sp8Q8BMJ8 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sp8Q8BMJ8 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sp8Q8BMJ8 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sp8Q8BMJ8 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sp8Q8BMJ8 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Sp8Q8BMJ8 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sp8Q8BMJ8 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sp8Q8BMJ8 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sp8Q8BMJ8 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sp8Q8BMJ8 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sp8Q8BMJ8 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms