Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGJ9

U2af1l4, Splicing factor U2AF 26 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af1l4Q8BGJ9 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
U2af1l4Q8BGJ9 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
U2af1l4Q8BGJ9 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
U2af1l4Q8BGJ9 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
U2af1l4Q8BGJ9 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
U2af1l4Q8BGJ9 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
U2af1l4Q8BGJ9 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
U2af1l4Q8BGJ9 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
U2af1l4Q8BGJ9 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
U2af1l4Q8BGJ9 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
U2af1l4Q8BGJ9 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
U2af1l4Q8BGJ9 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
U2af1l4Q8BGJ9 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
U2af1l4Q8BGJ9 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
U2af1l4Q8BGJ9 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
U2af1l4Q8BGJ9 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
U2af1l4Q8BGJ9 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
U2af1l4Q8BGJ9 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
U2af1l4Q8BGJ9 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
U2af1l4Q8BGJ9 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
U2af1l4Q8BGJ9 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
U2af1l4Q8BGJ9 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
U2af1l4Q8BGJ9 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
U2af1l4Q8BGJ9 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
U2af1l4Q8BGJ9 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
U2af1l4Q8BGJ9 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
U2af1l4Q8BGJ9 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
U2af1l4Q8BGJ9 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
U2af1l4Q8BGJ9 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
U2af1l4Q8BGJ9 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
U2af1l4Q8BGJ9 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
U2af1l4Q8BGJ9 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
U2af1l4Q8BGJ9 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
U2af1l4Q8BGJ9 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
U2af1l4Q8BGJ9 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
U2af1l4Q8BGJ9 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
U2af1l4Q8BGJ9 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
U2af1l4Q8BGJ9 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
U2af1l4Q8BGJ9 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
U2af1l4Q8BGJ9 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
U2af1l4Q8BGJ9 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
U2af1l4Q8BGJ9 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
U2af1l4Q8BGJ9 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
U2af1l4Q8BGJ9 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
U2af1l4Q8BGJ9 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
U2af1l4Q8BGJ9 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
U2af1l4Q8BGJ9 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
U2af1l4Q8BGJ9 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
U2af1l4Q8BGJ9 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
U2af1l4Q8BGJ9 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
U2af1l4Q8BGJ9 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
U2af1l4Q8BGJ9 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
U2af1l4Q8BGJ9 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
U2af1l4Q8BGJ9 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
U2af1l4Q8BGJ9 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
U2af1l4Q8BGJ9 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
U2af1l4Q8BGJ9 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
U2af1l4Q8BGJ9 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
U2af1l4Q8BGJ9 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
U2af1l4Q8BGJ9 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
U2af1l4Q8BGJ9 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
U2af1l4Q8BGJ9 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
U2af1l4Q8BGJ9 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
U2af1l4Q8BGJ9 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
U2af1l4Q8BGJ9 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
U2af1l4Q8BGJ9 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
U2af1l4Q8BGJ9 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
U2af1l4Q8BGJ9 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
U2af1l4Q8BGJ9 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
U2af1l4Q8BGJ9 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
U2af1l4Q8BGJ9 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
U2af1l4Q8BGJ9 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
U2af1l4Q8BGJ9 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
U2af1l4Q8BGJ9 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
U2af1l4Q8BGJ9 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
U2af1l4Q8BGJ9 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
U2af1l4Q8BGJ9 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
U2af1l4Q8BGJ9 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
U2af1l4Q8BGJ9 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
U2af1l4Q8BGJ9 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
U2af1l4Q8BGJ9 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
U2af1l4Q8BGJ9 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
U2af1l4Q8BGJ9 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
U2af1l4Q8BGJ9 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
U2af1l4Q8BGJ9 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
U2af1l4Q8BGJ9 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
U2af1l4Q8BGJ9 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
U2af1l4Q8BGJ9 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
U2af1l4Q8BGJ9 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
U2af1l4Q8BGJ9 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
U2af1l4Q8BGJ9 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
U2af1l4Q8BGJ9 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
U2af1l4Q8BGJ9 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
U2af1l4Q8BGJ9 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
U2af1l4Q8BGJ9 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
U2af1l4Q8BGJ9 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
U2af1l4Q8BGJ9 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
U2af1l4Q8BGJ9 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
U2af1l4Q8BGJ9 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
U2af1l4Q8BGJ9 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms