Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA5

Krr1, KRR1 small subunit processome component homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krr1Q8BGA5 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krr1Q8BGA5 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krr1Q8BGA5 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krr1Q8BGA5 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krr1Q8BGA5 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krr1Q8BGA5 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krr1Q8BGA5 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Krr1Q8BGA5 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Krr1Q8BGA5 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Krr1Q8BGA5 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Krr1Q8BGA5 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krr1Q8BGA5 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krr1Q8BGA5 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krr1Q8BGA5 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krr1Q8BGA5 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Krr1Q8BGA5 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krr1Q8BGA5 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krr1Q8BGA5 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krr1Q8BGA5 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krr1Q8BGA5 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krr1Q8BGA5 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krr1Q8BGA5 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krr1Q8BGA5 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krr1Q8BGA5 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krr1Q8BGA5 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krr1Q8BGA5 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krr1Q8BGA5 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krr1Q8BGA5 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krr1Q8BGA5 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krr1Q8BGA5 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krr1Q8BGA5 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krr1Q8BGA5 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krr1Q8BGA5 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krr1Q8BGA5 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krr1Q8BGA5 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krr1Q8BGA5 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krr1Q8BGA5 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Krr1Q8BGA5 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krr1Q8BGA5 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krr1Q8BGA5 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Krr1Q8BGA5 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krr1Q8BGA5 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krr1Q8BGA5 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krr1Q8BGA5 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krr1Q8BGA5 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krr1Q8BGA5 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krr1Q8BGA5 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krr1Q8BGA5 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krr1Q8BGA5 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krr1Q8BGA5 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krr1Q8BGA5 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krr1Q8BGA5 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krr1Q8BGA5 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krr1Q8BGA5 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krr1Q8BGA5 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krr1Q8BGA5 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krr1Q8BGA5 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krr1Q8BGA5 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krr1Q8BGA5 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krr1Q8BGA5 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krr1Q8BGA5 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krr1Q8BGA5 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Krr1Q8BGA5 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krr1Q8BGA5 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krr1Q8BGA5 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krr1Q8BGA5 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Krr1Q8BGA5 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krr1Q8BGA5 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krr1Q8BGA5 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krr1Q8BGA5 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krr1Q8BGA5 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krr1Q8BGA5 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krr1Q8BGA5 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krr1Q8BGA5 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krr1Q8BGA5 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krr1Q8BGA5 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krr1Q8BGA5 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krr1Q8BGA5 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krr1Q8BGA5 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krr1Q8BGA5 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krr1Q8BGA5 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krr1Q8BGA5 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krr1Q8BGA5 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krr1Q8BGA5 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krr1Q8BGA5 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krr1Q8BGA5 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krr1Q8BGA5 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krr1Q8BGA5 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krr1Q8BGA5 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krr1Q8BGA5 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krr1Q8BGA5 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krr1Q8BGA5 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krr1Q8BGA5 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krr1Q8BGA5 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krr1Q8BGA5 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krr1Q8BGA5 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krr1Q8BGA5 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krr1Q8BGA5 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Krr1Q8BGA5 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krr1Q8BGA5 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms